More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_06690 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
317 aa  616  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  61.43 
 
 
308 aa  341  9e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  60.94 
 
 
309 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  59.4 
 
 
317 aa  329  4e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  60.07 
 
 
306 aa  325  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.36 
 
 
302 aa  325  5e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  59.54 
 
 
309 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  58.8 
 
 
300 aa  320  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  60.27 
 
 
305 aa  319  3e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.72 
 
 
337 aa  318  7e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  57.34 
 
 
308 aa  317  2e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  58.59 
 
 
297 aa  315  5e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  58.78 
 
 
307 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  58.36 
 
 
311 aa  314  9.999999999999999e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  57.76 
 
 
306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  51.36 
 
 
298 aa  312  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  55.74 
 
 
308 aa  311  5.999999999999999e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  58.9 
 
 
298 aa  312  5.999999999999999e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.28 
 
 
324 aa  310  2e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  58.14 
 
 
309 aa  309  4e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  55.45 
 
 
316 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  55.03 
 
 
340 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.28 
 
 
312 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  58.98 
 
 
302 aa  304  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  58.59 
 
 
302 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  56.33 
 
 
306 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  50 
 
 
302 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  56.95 
 
 
312 aa  300  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  58.33 
 
 
302 aa  300  3e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  55.78 
 
 
300 aa  297  1e-79  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  56.52 
 
 
308 aa  294  1e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  54.73 
 
 
299 aa  293  2e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  54.42 
 
 
301 aa  288  7e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  58.31 
 
 
305 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  53.18 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  53.18 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  53.18 
 
 
313 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  51.92 
 
 
328 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.89 
 
 
302 aa  273  3e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  54.61 
 
 
300 aa  269  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  57.41 
 
 
247 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  51.16 
 
 
304 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  50.33 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  50.33 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  50.17 
 
 
307 aa  242  6e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.54 
 
 
300 aa  220  3e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  41.75 
 
 
307 aa  208  8e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.93 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
304 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.93 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  43.26 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  35.22 
 
 
297 aa  196  6e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
297 aa  195  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
297 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
297 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
297 aa  194  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
297 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
314 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
297 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  42.33 
 
 
297 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
297 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  42.18 
 
 
303 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  42.2 
 
 
305 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  32.19 
 
 
297 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  32.65 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
304 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  38.83 
 
 
293 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
390 aa  182  7e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  42.44 
 
 
299 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
306 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.02 
 
 
293 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  33.03 
 
 
295 aa  171  2e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  35.33 
 
 
313 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  42.4 
 
 
307 aa  169  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.01 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  24.24 
 
 
290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.14 
 
 
309 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
304 aa  162  9e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.94 
 
 
304 aa  162  9e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
310 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.07 
 
 
309 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
327 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  39.14 
 
 
747 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.45 
 
 
337 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  42.44 
 
 
249 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.06 
 
 
353 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  46.85 
 
 
302 aa  157  3e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  34.3 
 
 
247 aa  157  3e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  39.4 
 
 
319 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
256 aa  155  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  43.84 
 
 
323 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.34 
 
 
300 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  30.82 
 
 
313 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  46.08 
 
 
316 aa  154  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
304 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2234  ABC transporter related  45.02 
 
 
323 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.686469  normal  0.247655 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  40.49 
 
 
318 aa  153  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>