More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7394 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
306 aa  598  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  53.9 
 
 
300 aa  325  9e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  56.08 
 
 
304 aa  295  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  52.16 
 
 
307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  48.67 
 
 
307 aa  268  8.999999999999999e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  52.51 
 
 
303 aa  261  6.999999999999999e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  45.82 
 
 
304 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  38.01 
 
 
293 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  42.09 
 
 
313 aa  225  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
297 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 
297 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  39.53 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.37 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
297 aa  219  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
297 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
297 aa  219  3e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
297 aa  219  3e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  44.93 
 
 
305 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
297 aa  219  5e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
297 aa  218  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  43.24 
 
 
309 aa  216  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  41.38 
 
 
305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  43.88 
 
 
307 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  43.88 
 
 
307 aa  210  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 
307 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  43.54 
 
 
307 aa  209  4e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  42 
 
 
298 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  43.31 
 
 
316 aa  208  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
300 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  35.27 
 
 
302 aa  206  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.96 
 
 
291 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.01 
 
 
297 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.48 
 
 
302 aa  204  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  44.87 
 
 
317 aa  203  4e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  42.57 
 
 
306 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  39.88 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.77 
 
 
339 aa  200  3e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
390 aa  200  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  42.51 
 
 
306 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  36.15 
 
 
293 aa  199  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  41.78 
 
 
308 aa  198  9e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.93 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  42.96 
 
 
304 aa  196  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  43.92 
 
 
305 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  41.18 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.51 
 
 
324 aa  196  4.0000000000000005e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  38.82 
 
 
308 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
308 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  33.99 
 
 
290 aa  194  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  39.14 
 
 
302 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  36.18 
 
 
298 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  39.93 
 
 
306 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  40.74 
 
 
299 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  32.21 
 
 
314 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  38.44 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  30.13 
 
 
295 aa  187  1e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  38.46 
 
 
311 aa  188  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  40.38 
 
 
328 aa  187  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  39.54 
 
 
340 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  42.67 
 
 
312 aa  186  5e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  37.95 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  39 
 
 
302 aa  183  3e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  38.93 
 
 
297 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 
293 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.62 
 
 
337 aa  181  1e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  40.8 
 
 
346 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  36 
 
 
286 aa  179  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.1 
 
 
312 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  36.69 
 
 
298 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.39 
 
 
299 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  40.47 
 
 
300 aa  175  7e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.66 
 
 
317 aa  175  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  41.02 
 
 
301 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  37.54 
 
 
300 aa  171  9e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
316 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
310 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.54 
 
 
309 aa  169  7e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.11 
 
 
298 aa  168  9e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  38.19 
 
 
310 aa  168  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  40.14 
 
 
313 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  40.14 
 
 
313 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  40.14 
 
 
313 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  39.34 
 
 
303 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
309 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  37.3 
 
 
291 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  45.37 
 
 
300 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  41.95 
 
 
309 aa  165  9e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.87 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.89 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.59 
 
 
318 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  40.83 
 
 
247 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  40 
 
 
304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  32.77 
 
 
247 aa  162  7e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
321 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  29.37 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.03 
 
 
301 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.38 
 
 
316 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>