More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3201 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  100 
 
 
309 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  68.24 
 
 
300 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  69.97 
 
 
302 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  67.11 
 
 
309 aa  409  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  68.71 
 
 
302 aa  404  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  67.34 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  68.2 
 
 
308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  68.03 
 
 
305 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  69.39 
 
 
302 aa  403  1e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  68.9 
 
 
312 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  67.94 
 
 
308 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  68.04 
 
 
307 aa  394  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  67.94 
 
 
308 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  68.33 
 
 
306 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  65.65 
 
 
298 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.77 
 
 
312 aa  387  1e-106  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  64.88 
 
 
309 aa  384  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  64.92 
 
 
340 aa  382  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  69.18 
 
 
300 aa  375  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  64.24 
 
 
302 aa  372  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  59.12 
 
 
302 aa  367  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  62.75 
 
 
311 aa  369  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  64.29 
 
 
306 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  65.64 
 
 
305 aa  364  1e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  62.05 
 
 
306 aa  363  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  62.54 
 
 
308 aa  362  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  64.83 
 
 
297 aa  361  8e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.87 
 
 
337 aa  360  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  55.71 
 
 
298 aa  353  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  62.37 
 
 
299 aa  352  5e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  60 
 
 
317 aa  347  2e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  61.86 
 
 
313 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  61.86 
 
 
313 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  61.86 
 
 
313 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  61.38 
 
 
301 aa  341  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  57.83 
 
 
328 aa  339  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  60.76 
 
 
300 aa  338  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.94 
 
 
317 aa  333  3e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.15 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.66 
 
 
302 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  61.29 
 
 
247 aa  285  8e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  52.88 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  52.88 
 
 
307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  52.54 
 
 
307 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  50.87 
 
 
304 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.93 
 
 
300 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
304 aa  228  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  44.14 
 
 
303 aa  222  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  42.28 
 
 
307 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  41.98 
 
 
304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  43.24 
 
 
306 aa  216  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  39.66 
 
 
297 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
297 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  39.45 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  39.45 
 
 
297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  38.26 
 
 
305 aa  209  5e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 
297 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.4 
 
 
297 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  39.87 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
390 aa  196  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  35.07 
 
 
291 aa  195  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  34.46 
 
 
314 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  38.18 
 
 
339 aa  193  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.42 
 
 
293 aa  187  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  34.45 
 
 
299 aa  186  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.03 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  35.91 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  29.62 
 
 
290 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
293 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.91 
 
 
305 aa  182  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  39.14 
 
 
305 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
313 aa  179  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  42.31 
 
 
249 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  38.99 
 
 
346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
310 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.77 
 
 
316 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.24 
 
 
300 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.14 
 
 
332 aa  167  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.53 
 
 
309 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
327 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.31 
 
 
256 aa  165  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  29.97 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  35.81 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 
295 aa  163  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  34.81 
 
 
308 aa  163  3e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  42.25 
 
 
318 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.44 
 
 
279 aa  162  6e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.67 
 
 
305 aa  162  9e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  37.77 
 
 
367 aa  162  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  41.44 
 
 
309 aa  161  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  41.81 
 
 
301 aa  160  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
316 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
309 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>