More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25800 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
312 aa  617  1e-175  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  82.37 
 
 
312 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  70.65 
 
 
305 aa  408  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  70.07 
 
 
302 aa  410  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  69.1 
 
 
300 aa  403  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  64.77 
 
 
309 aa  387  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  66.78 
 
 
309 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  68.97 
 
 
305 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  63.73 
 
 
311 aa  380  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  64.53 
 
 
306 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  65.86 
 
 
307 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  64.95 
 
 
298 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  65.97 
 
 
316 aa  365  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  63.36 
 
 
308 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  60.32 
 
 
309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  62.46 
 
 
302 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  61.82 
 
 
302 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  61.72 
 
 
308 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  62.03 
 
 
308 aa  350  1e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  61.56 
 
 
299 aa  350  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  61.69 
 
 
340 aa  350  2e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  59.74 
 
 
306 aa  350  2e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  60.61 
 
 
306 aa  348  5e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  59.6 
 
 
308 aa  348  9e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  62.89 
 
 
302 aa  342  4e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.17 
 
 
337 aa  338  7e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  57.63 
 
 
301 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  57.74 
 
 
328 aa  337  1.9999999999999998e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  52.58 
 
 
298 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  57.14 
 
 
300 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  58.56 
 
 
300 aa  328  5.0000000000000004e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  58.56 
 
 
297 aa  328  6e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  51.2 
 
 
302 aa  323  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  57.76 
 
 
317 aa  320  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.56 
 
 
324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  54.92 
 
 
313 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  54.92 
 
 
313 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  54.92 
 
 
313 aa  315  7e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.28 
 
 
317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.63 
 
 
302 aa  295  8e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  51.38 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  51.38 
 
 
307 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  51.03 
 
 
307 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  56.22 
 
 
247 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  49.18 
 
 
304 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  41.55 
 
 
304 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  38.18 
 
 
300 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  38.1 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
297 aa  210  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
297 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
297 aa  209  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 
297 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
297 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 
297 aa  209  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 
297 aa  209  5e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  43 
 
 
303 aa  208  8e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 
297 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  42.33 
 
 
307 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.99 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  32.25 
 
 
314 aa  199  5e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.29 
 
 
293 aa  198  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.56 
 
 
291 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.27 
 
 
299 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
390 aa  192  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  33.67 
 
 
297 aa  191  1e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  35.43 
 
 
305 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  32.99 
 
 
293 aa  182  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.03 
 
 
290 aa  177  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
306 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.18 
 
 
307 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.59 
 
 
339 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
313 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  30 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.3 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.83 
 
 
250 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.87 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.18 
 
 
332 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  40.91 
 
 
326 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  30.74 
 
 
313 aa  160  2e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
327 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
256 aa  159  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 
304 aa  159  6e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 
309 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.77 
 
 
304 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  31.78 
 
 
247 aa  158  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  40.77 
 
 
747 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  38.87 
 
 
316 aa  155  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  26.62 
 
 
295 aa  155  8e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
346 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 
304 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
301 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  35.71 
 
 
300 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  38.73 
 
 
305 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
316 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  40.08 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>