More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0655 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
295 aa  592  1e-168  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  44.56 
 
 
297 aa  266  2e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  44.37 
 
 
297 aa  254  8e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  43.43 
 
 
297 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  43.71 
 
 
297 aa  252  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  42.81 
 
 
297 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  38 
 
 
305 aa  251  9.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  43.81 
 
 
297 aa  251  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 
297 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
297 aa  249  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  43.48 
 
 
297 aa  249  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
297 aa  249  4e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  43.1 
 
 
293 aa  248  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
297 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  41.38 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 
314 aa  237  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  40.44 
 
 
293 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  43.96 
 
 
247 aa  199  3e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.23 
 
 
293 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  33.33 
 
 
307 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  35.84 
 
 
299 aa  199  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  35.59 
 
 
300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  36.9 
 
 
290 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  42.6 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  32.54 
 
 
298 aa  189  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  30.13 
 
 
306 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  32.32 
 
 
304 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  34.69 
 
 
302 aa  187  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  31.6 
 
 
308 aa  187  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  31.08 
 
 
297 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  31.74 
 
 
313 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  31.74 
 
 
313 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  31.74 
 
 
313 aa  182  6e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  38.51 
 
 
286 aa  181  1e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  30.61 
 
 
306 aa  179  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  30.56 
 
 
309 aa  179  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  30.87 
 
 
306 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  28.57 
 
 
303 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  30.85 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  30.98 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  30.1 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  32.47 
 
 
327 aa  173  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  31.85 
 
 
311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  29.66 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  42.03 
 
 
313 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  35.59 
 
 
390 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.03 
 
 
317 aa  171  2e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  33.23 
 
 
339 aa  170  3e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  29.14 
 
 
340 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  29.49 
 
 
308 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.93 
 
 
302 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  28.52 
 
 
316 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  28.77 
 
 
308 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  28.92 
 
 
307 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  30.17 
 
 
337 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  29.69 
 
 
299 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  29.83 
 
 
298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  30.61 
 
 
309 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  28.62 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  29.45 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  29.62 
 
 
308 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0997  ABC transporter related  37.07 
 
 
291 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.437755 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  27.48 
 
 
317 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.19 
 
 
316 aa  159  7e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.88 
 
 
316 aa  156  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  27.21 
 
 
304 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  29.63 
 
 
307 aa  155  5.0000000000000005e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  30.07 
 
 
300 aa  155  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  26.62 
 
 
312 aa  155  7e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  36.41 
 
 
313 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  30.03 
 
 
307 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  30.03 
 
 
307 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  36.96 
 
 
247 aa  154  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  38.5 
 
 
319 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  31.44 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  28.52 
 
 
302 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  26.49 
 
 
302 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  33.64 
 
 
247 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  29.7 
 
 
307 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  33.64 
 
 
305 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  28.62 
 
 
309 aa  152  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  27.27 
 
 
302 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  29.77 
 
 
305 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  33.33 
 
 
339 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  27.42 
 
 
312 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  30.84 
 
 
328 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  31.63 
 
 
315 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.02 
 
 
337 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  33.33 
 
 
332 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  32.68 
 
 
302 aa  150  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  40.57 
 
 
306 aa  149  4e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  33.03 
 
 
303 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  33.49 
 
 
250 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.02 
 
 
307 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.07 
 
 
309 aa  149  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  34.32 
 
 
318 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  32.38 
 
 
346 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
306 aa  148  9e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>