More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0014 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  69.18 
 
 		 309 aa  411  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  65.74 
 
 		 302 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  64.38 
 
 		 302 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.79 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  61.2 
 
 		 306 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  64.26 
 
 		 308 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  62.12 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  59.53 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  59.32 
 
 		 308 aa  365  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  59.52 
 
 		 308 aa  363  1e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  61.75 
 
 		 300 aa  363  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  60.34 
 
 		 307 aa  361  1e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  59.86 
 
 		 316 aa  358  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  61.36 
 
 		 309 aa  359  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 305 aa  358  6e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.76 
 
 		 312 aa  358  6e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  54.39 
 
 		 302 aa  356  2.9999999999999997e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  58.68 
 
 		 311 aa  351  8.999999999999999e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  52.43 
 
 		 298 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  58.13 
 
 		 306 aa  345  6e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 309 aa  345  6e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  59.93 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  57.04 
 
 		 298 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  56.46 
 
 		 299 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  57.38 
 
 		 340 aa  340  2e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  56.95 
 
 		 306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  54.81 
 
 		 328 aa  335  5.999999999999999e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  58.08 
 
 		 305 aa  333  1e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  58.42 
 
 		 302 aa  329  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  57.58 
 
 		 301 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  57.24 
 
 		 317 aa  328  8e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  56.76 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  56.36 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  56.36 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  56.36 
 
 		 313 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.34 
 
 		 337 aa  319  3e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.98 
 
 		 324 aa  308  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.9 
 
 		 302 aa  301  1e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.61 
 
 		 317 aa  298  1e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  56.48 
 
 		 247 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  49.12 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  49.12 
 
 		 307 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  48.77 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  46.55 
 
 		 304 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  37.41 
 
 		 297 aa  219  3e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  37.29 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  37.07 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 		 297 aa  217  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  36.18 
 
 		 300 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 304 aa  215  9e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.73 
 
 		 297 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  39.13 
 
 		 307 aa  208  9e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  37.84 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 390 aa  195  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  37.8 
 
 		 307 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  31.85 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  35.15 
 
 		 305 aa  190  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  31.85 
 
 		 293 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  32.19 
 
 		 297 aa  187  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.45 
 
 		 293 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  31.31 
 
 		 314 aa  185  9e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.27 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37 
 
 		 310 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.73 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  30.93 
 
 		 293 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  32.31 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.99 
 
 		 290 aa  174  1.9999999999999998e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.28 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 308 aa  169  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.53 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  36.39 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  28.12 
 
 		 286 aa  168  8e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.44 
 
 		 309 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  36.12 
 
 		 308 aa  168  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  34.75 
 
 		 334 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.56 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  33.55 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.53 
 
 		 250 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  28.77 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  36.52 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.23 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.69 
 
 		 332 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 346 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.88 
 
 		 318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  34.01 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  42.86 
 
 		 299 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 		 304 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.46 
 
 		 301 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  37.12 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>