More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0298 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  100 
 
 
367 aa  723    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  43.67 
 
 
318 aa  249  8e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  42.14 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  43.94 
 
 
325 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  42.95 
 
 
288 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  45.82 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  42.17 
 
 
309 aa  239  5e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  55.16 
 
 
247 aa  236  4e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  38.97 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  51.12 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  40.12 
 
 
326 aa  233  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  51.12 
 
 
318 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  40.51 
 
 
287 aa  228  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  51.82 
 
 
247 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  48.67 
 
 
310 aa  228  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  41.03 
 
 
304 aa  226  4e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 
296 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  40.06 
 
 
287 aa  220  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  49.54 
 
 
315 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  41.77 
 
 
330 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  40.94 
 
 
303 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  41.27 
 
 
305 aa  216  7e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  45.78 
 
 
292 aa  211  1e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  39.31 
 
 
326 aa  202  5e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  40.99 
 
 
310 aa  202  6e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  42.01 
 
 
331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  39.69 
 
 
310 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  36.59 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  47.27 
 
 
298 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  37.46 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  43.04 
 
 
311 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.97 
 
 
305 aa  182  8.000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  42.73 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  40.55 
 
 
308 aa  179  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 
356 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  45.36 
 
 
303 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.05 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  46.8 
 
 
313 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.94 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 
305 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  41.26 
 
 
316 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.75 
 
 
279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  43.42 
 
 
313 aa  173  5e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  46.31 
 
 
313 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.59 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
305 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  43.75 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
327 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.85 
 
 
309 aa  172  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.92 
 
 
327 aa  172  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  36.56 
 
 
305 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1980  ABC transporter, ATP-binding protein  33.54 
 
 
300 aa  171  2e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
305 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 
305 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
305 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  34.88 
 
 
302 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
305 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  34.67 
 
 
305 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  45.7 
 
 
316 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  45.54 
 
 
332 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
304 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  33.95 
 
 
319 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2035  ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 
300 aa  167  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0885424  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
305 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  36.81 
 
 
310 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 
306 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.07 
 
 
301 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  39.2 
 
 
309 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.31 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  42.86 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  36.65 
 
 
320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.31 
 
 
306 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 
317 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
309 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  35.74 
 
 
308 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  41.7 
 
 
303 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.39 
 
 
314 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  39.37 
 
 
342 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  45.07 
 
 
373 aa  166  5e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05770  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.85 
 
 
299 aa  166  5e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.396755  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1206  ABC transporter related  35.06 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.406945  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  33.87 
 
 
350 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
346 aa  166  6.9999999999999995e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  33.53 
 
 
323 aa  166  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  45.83 
 
 
319 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  44.07 
 
 
304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.09 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2734  ABC transporter related  32.54 
 
 
341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  42.53 
 
 
360 aa  165  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  38.58 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  37.2 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  36.24 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  34.38 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  39.15 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>