More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5390 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
307 aa  607  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  74.09 
 
 
305 aa  424  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  71.1 
 
 
305 aa  420  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  71.23 
 
 
300 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  73.29 
 
 
302 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  70.31 
 
 
298 aa  411  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  69.52 
 
 
309 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  68.04 
 
 
309 aa  394  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  68.73 
 
 
308 aa  393  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  68.26 
 
 
306 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  69.66 
 
 
312 aa  390  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  66.55 
 
 
308 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  65.87 
 
 
308 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  67.36 
 
 
316 aa  381  1e-104  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  66.22 
 
 
302 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.86 
 
 
312 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  63.19 
 
 
311 aa  376  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  65.54 
 
 
302 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  64.43 
 
 
340 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  64.26 
 
 
302 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
309 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  64.04 
 
 
297 aa  362  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  61.24 
 
 
308 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  63.89 
 
 
306 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  61.09 
 
 
328 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  60.76 
 
 
306 aa  346  3e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  61.56 
 
 
317 aa  345  8e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  60.81 
 
 
299 aa  342  7e-93  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  55.36 
 
 
302 aa  340  2e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.17 
 
 
337 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  53.98 
 
 
298 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  59.04 
 
 
313 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  59.04 
 
 
313 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  59.04 
 
 
313 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  58.08 
 
 
300 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  57.19 
 
 
301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.81 
 
 
324 aa  325  9e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  60.14 
 
 
300 aa  323  3e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.78 
 
 
317 aa  314  9e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.75 
 
 
302 aa  296  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  60.73 
 
 
247 aa  276  5e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  50.69 
 
 
307 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  50.69 
 
 
307 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  50.34 
 
 
307 aa  256  5e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  40.96 
 
 
300 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  48.65 
 
 
304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  42.76 
 
 
304 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  38.59 
 
 
297 aa  219  3e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
297 aa  217  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
304 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  37.92 
 
 
297 aa  216  4e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 
297 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
297 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  37.21 
 
 
297 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
297 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
297 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  36.88 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 
297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  43.25 
 
 
303 aa  213  3.9999999999999995e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  41.61 
 
 
390 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 
306 aa  209  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  36.68 
 
 
291 aa  209  6e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  34.41 
 
 
314 aa  204  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  41.86 
 
 
307 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.62 
 
 
297 aa  204  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  36.46 
 
 
293 aa  195  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  30.34 
 
 
290 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  36.99 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  34.81 
 
 
293 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  36.25 
 
 
305 aa  189  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  33.1 
 
 
293 aa  188  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38 
 
 
307 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  32.4 
 
 
286 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  33.78 
 
 
299 aa  179  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.46 
 
 
305 aa  179  8e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.48 
 
 
332 aa  178  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
327 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  40.06 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.13 
 
 
339 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  43.04 
 
 
249 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  38.19 
 
 
338 aa  170  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.5 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  39.12 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  28.92 
 
 
295 aa  166  4e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.61 
 
 
250 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.18 
 
 
326 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  39.57 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  39.12 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.81 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  37.44 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.41 
 
 
300 aa  162  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  37.55 
 
 
256 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
323 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
310 aa  161  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
305 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  36.79 
 
 
304 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
310 aa  160  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
310 aa  159  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>