More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0101 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  100 
 
 
299 aa  591  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  66.67 
 
 
305 aa  372  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  64.81 
 
 
300 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  64.67 
 
 
309 aa  369  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.52 
 
 
302 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  63.36 
 
 
309 aa  359  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  62.63 
 
 
308 aa  358  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  61.86 
 
 
306 aa  354  8.999999999999999e-97  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  63.27 
 
 
312 aa  354  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  61.67 
 
 
311 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  62.37 
 
 
309 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.56 
 
 
312 aa  350  1e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  61.56 
 
 
306 aa  350  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  62.37 
 
 
316 aa  350  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  57.24 
 
 
302 aa  345  7e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  62.89 
 
 
308 aa  343  1e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  60.81 
 
 
307 aa  342  5.999999999999999e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  60.98 
 
 
306 aa  342  7e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  63.51 
 
 
340 aa  341  1e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  61.11 
 
 
298 aa  339  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  60.28 
 
 
302 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  59.52 
 
 
308 aa  338  7e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  58.72 
 
 
301 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  59.52 
 
 
308 aa  334  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  59.11 
 
 
297 aa  334  7.999999999999999e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  61.82 
 
 
305 aa  333  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  59.93 
 
 
302 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  55.12 
 
 
298 aa  331  7.000000000000001e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.48 
 
 
337 aa  331  1e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  58.25 
 
 
300 aa  329  4e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  58.45 
 
 
317 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  58.7 
 
 
302 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  55.7 
 
 
328 aa  319  3.9999999999999996e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  56.71 
 
 
313 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  56.71 
 
 
313 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  56.71 
 
 
313 aa  317  1e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  56.31 
 
 
300 aa  311  5.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.26 
 
 
324 aa  306  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.73 
 
 
317 aa  293  2e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.64 
 
 
302 aa  286  2.9999999999999996e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  59.26 
 
 
247 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  52.58 
 
 
304 aa  258  7e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  49.15 
 
 
307 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  49.15 
 
 
307 aa  250  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  48.81 
 
 
307 aa  248  6e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  40 
 
 
304 aa  228  1e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 
297 aa  225  6e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  38.62 
 
 
300 aa  225  7e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
297 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 
297 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
297 aa  223  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
297 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  40.41 
 
 
297 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  39.59 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 
297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  43.1 
 
 
304 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  41.5 
 
 
303 aa  202  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.45 
 
 
291 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.71 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  38.21 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  39.12 
 
 
307 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  34.34 
 
 
314 aa  195  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.94 
 
 
390 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.36 
 
 
293 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  40.74 
 
 
306 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.9 
 
 
293 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
313 aa  185  8e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  36.67 
 
 
307 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  29.55 
 
 
290 aa  182  5.0000000000000004e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  32.53 
 
 
293 aa  178  9e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  38.17 
 
 
339 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
327 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  30.58 
 
 
293 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  33.45 
 
 
299 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  30.31 
 
 
286 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  29.69 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  31.71 
 
 
313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  36.3 
 
 
303 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  40.25 
 
 
249 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  34.09 
 
 
308 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  38.67 
 
 
304 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  38.67 
 
 
304 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
310 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
309 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  40.18 
 
 
259 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
256 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  33.17 
 
 
247 aa  152  8e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
318 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.46 
 
 
332 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  33.98 
 
 
309 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
305 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.88 
 
 
303 aa  150  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.95 
 
 
301 aa  149  4e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 
309 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  35.43 
 
 
327 aa  149  8e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 
322 aa  149  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.56 
 
 
308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  35.69 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>