More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2618 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  100 
 
 
317 aa  623  1e-177  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.64 
 
 
324 aa  377  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  60.54 
 
 
300 aa  352  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  60 
 
 
309 aa  352  5.9999999999999994e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  60 
 
 
309 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  60.2 
 
 
308 aa  346  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  61.56 
 
 
307 aa  345  8e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  58.55 
 
 
308 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  62.2 
 
 
316 aa  343  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  63.01 
 
 
302 aa  342  2.9999999999999997e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  61.41 
 
 
305 aa  342  5.999999999999999e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  60.93 
 
 
297 aa  340  2e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  60.07 
 
 
298 aa  337  9.999999999999999e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  57.81 
 
 
306 aa  332  7.000000000000001e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  59.46 
 
 
308 aa  331  8e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  57.72 
 
 
306 aa  330  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.4 
 
 
317 aa  329  4e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  58.94 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  58.75 
 
 
302 aa  326  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  58.45 
 
 
299 aa  324  1e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  62.8 
 
 
305 aa  322  4e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  57.72 
 
 
306 aa  322  6e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  56.7 
 
 
311 aa  321  9.000000000000001e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  56.57 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.76 
 
 
312 aa  320  9.999999999999999e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  56.95 
 
 
302 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  57.38 
 
 
308 aa  318  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  58.06 
 
 
312 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  57.05 
 
 
309 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  57 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  57 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  57 
 
 
313 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  56.15 
 
 
300 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  56.29 
 
 
301 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.7 
 
 
337 aa  297  2e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  57.24 
 
 
300 aa  294  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  46.94 
 
 
298 aa  290  2e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  49.83 
 
 
302 aa  288  9e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  52.6 
 
 
328 aa  282  6.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 
302 aa  268  8.999999999999999e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  56.02 
 
 
247 aa  248  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  50.68 
 
 
307 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  50.68 
 
 
307 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  50.34 
 
 
307 aa  235  6e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  47.02 
 
 
304 aa  229  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  41.75 
 
 
304 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  35.62 
 
 
300 aa  205  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 
306 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  41.55 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  37.2 
 
 
297 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  42.36 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  38.31 
 
 
305 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 
297 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.74 
 
 
307 aa  186  6e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 
314 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.97 
 
 
291 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.33 
 
 
293 aa  181  1e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  31.48 
 
 
297 aa  181  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  33.11 
 
 
293 aa  181  2e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.59 
 
 
307 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
305 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
346 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 
293 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.38 
 
 
316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
327 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  39.18 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  29.11 
 
 
286 aa  163  3e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.96 
 
 
290 aa  163  4.0000000000000004e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  35.24 
 
 
247 aa  162  6e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.2 
 
 
299 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.44 
 
 
316 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  43.64 
 
 
249 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  27.48 
 
 
295 aa  159  6e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  29.97 
 
 
293 aa  159  7e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  41.2 
 
 
309 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.79 
 
 
309 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.91 
 
 
332 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  34.95 
 
 
339 aa  157  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  41.86 
 
 
316 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
318 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.44 
 
 
337 aa  156  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
313 aa  155  7e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  37.56 
 
 
313 aa  155  8e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
309 aa  155  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  42.22 
 
 
279 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
301 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
311 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  35.02 
 
 
313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.31 
 
 
347 aa  152  8e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  39.55 
 
 
319 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.25 
 
 
300 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>