More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_16530 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
337 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  63.09 
 
 
306 aa  375  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  63.18 
 
 
306 aa  368  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  64.29 
 
 
309 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  61.44 
 
 
308 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  59.33 
 
 
300 aa  361  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  61.87 
 
 
309 aa  360  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  61.54 
 
 
340 aa  359  3e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.59 
 
 
302 aa  355  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  59.08 
 
 
309 aa  352  5e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  60.68 
 
 
316 aa  349  4e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  59.38 
 
 
308 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  58.84 
 
 
306 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  58.33 
 
 
308 aa  340  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.17 
 
 
312 aa  338  7e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  59.17 
 
 
307 aa  335  5e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  59.79 
 
 
301 aa  335  7e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  58.76 
 
 
302 aa  334  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  61.94 
 
 
308 aa  333  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  59.39 
 
 
302 aa  333  3e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  58.33 
 
 
311 aa  333  3e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  60.69 
 
 
312 aa  332  4e-90  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  50.67 
 
 
302 aa  332  8e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  61.48 
 
 
299 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  59.86 
 
 
298 aa  328  8e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  58.98 
 
 
313 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  58.98 
 
 
313 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  58.98 
 
 
313 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  58.28 
 
 
305 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  59.4 
 
 
297 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  59.86 
 
 
305 aa  322  6e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  51.06 
 
 
298 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  57.64 
 
 
300 aa  321  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.72 
 
 
317 aa  318  7e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  55.63 
 
 
302 aa  306  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  58.7 
 
 
317 aa  297  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  57.34 
 
 
300 aa  295  6e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.36 
 
 
302 aa  292  5e-78  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.63 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  49.34 
 
 
328 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  57.08 
 
 
247 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  48.97 
 
 
304 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  47.22 
 
 
307 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  47.22 
 
 
307 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  46.88 
 
 
307 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
304 aa  207  1e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  40.86 
 
 
307 aa  207  3e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  36.52 
 
 
300 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  37.76 
 
 
297 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.46 
 
 
297 aa  203  4e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.68 
 
 
297 aa  202  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  202  9e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  36.11 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
304 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  35.62 
 
 
291 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.49 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  39.8 
 
 
303 aa  192  6e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.03 
 
 
297 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.15 
 
 
293 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  37.16 
 
 
305 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  39.07 
 
 
307 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
390 aa  182  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  40.62 
 
 
306 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
314 aa  176  4e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  35.03 
 
 
299 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.99 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
313 aa  172  7.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
327 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  31.97 
 
 
293 aa  169  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  35.65 
 
 
339 aa  166  4e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  30.17 
 
 
295 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  30.21 
 
 
286 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
256 aa  165  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36 
 
 
353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.11 
 
 
250 aa  162  6e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.49 
 
 
290 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32.26 
 
 
316 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  36.77 
 
 
300 aa  159  6e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.17 
 
 
348 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
305 aa  156  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33 
 
 
309 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  39.38 
 
 
306 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.67 
 
 
310 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.22 
 
 
309 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  41.82 
 
 
254 aa  152  8e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  35.26 
 
 
346 aa  152  8.999999999999999e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.55 
 
 
316 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.97 
 
 
337 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  35.53 
 
 
301 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  41.74 
 
 
322 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
253 aa  151  2e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  36.58 
 
 
305 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  39.29 
 
 
308 aa  150  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  31.25 
 
 
369 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  37.86 
 
 
316 aa  150  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>