More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1047 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
308 aa  615  1e-175  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  44.75 
 
 
298 aa  261  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  42.81 
 
 
300 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  43.73 
 
 
298 aa  257  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  43.73 
 
 
298 aa  255  6e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  44.15 
 
 
305 aa  253  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  42.23 
 
 
305 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  43.14 
 
 
321 aa  248  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  42.72 
 
 
309 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 
319 aa  238  1e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  42.72 
 
 
304 aa  237  2e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  40.4 
 
 
309 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.26 
 
 
299 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
309 aa  230  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  40.53 
 
 
309 aa  229  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 
301 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  38.89 
 
 
315 aa  224  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  41.69 
 
 
266 aa  219  5e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  41.16 
 
 
298 aa  218  7e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  42.67 
 
 
296 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 
296 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.99 
 
 
297 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 
299 aa  209  4e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
303 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
294 aa  209  5e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  39.66 
 
 
303 aa  207  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
294 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 
294 aa  206  4e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  39.32 
 
 
303 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  38.91 
 
 
293 aa  205  8e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  37.59 
 
 
299 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  37.59 
 
 
299 aa  205  9e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.54 
 
 
326 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  39.53 
 
 
294 aa  204  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
294 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  39.67 
 
 
294 aa  203  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  40.53 
 
 
303 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  38.8 
 
 
294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.87 
 
 
309 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  38.95 
 
 
294 aa  200  3e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  35.31 
 
 
292 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  43.33 
 
 
294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  35.81 
 
 
326 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  36.08 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  33.67 
 
 
318 aa  197  3e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  35.62 
 
 
292 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  37.32 
 
 
315 aa  195  8.000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  37.5 
 
 
317 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  36.24 
 
 
307 aa  194  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  34.02 
 
 
303 aa  193  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.84 
 
 
291 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  35.49 
 
 
406 aa  193  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.83 
 
 
312 aa  191  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.2 
 
 
309 aa  191  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  41.82 
 
 
305 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  36.99 
 
 
298 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  36.64 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  34.81 
 
 
329 aa  188  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.99 
 
 
312 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.43 
 
 
298 aa  186  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  38.6 
 
 
332 aa  185  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  34.71 
 
 
303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  40.45 
 
 
316 aa  183  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  32.12 
 
 
305 aa  182  4.0000000000000006e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  33.1 
 
 
293 aa  182  6e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  34.27 
 
 
318 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  34.35 
 
 
290 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  33.11 
 
 
297 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  36.54 
 
 
296 aa  178  1e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.35 
 
 
251 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 
245 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.55 
 
 
316 aa  176  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  37 
 
 
306 aa  176  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  41.33 
 
 
293 aa  175  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.19 
 
 
304 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
274 aa  172  6.999999999999999e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.32 
 
 
321 aa  170  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  31.96 
 
 
294 aa  170  2e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  39.73 
 
 
304 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  37.83 
 
 
341 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.84 
 
 
312 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.23 
 
 
309 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
309 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  40.35 
 
 
244 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  34.01 
 
 
309 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.24 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.56 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  34.44 
 
 
282 aa  166  2.9999999999999998e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  33.11 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  37.3 
 
 
320 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 
311 aa  166  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 
306 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.7 
 
 
308 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
309 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.63 
 
 
330 aa  165  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  31.27 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.73 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.09 
 
 
320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>