More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1135 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  100 
 
 
301 aa  602  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0605  ABC transporter-like protein  74.67 
 
 
308 aa  447  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.547486  normal  0.781825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4278  ABC transporter related protein  71.14 
 
 
356 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.786562  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1852  ABC transporter related protein  66.44 
 
 
304 aa  375  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0481458  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4445  ABC transporter related  65.89 
 
 
313 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0454  ABC transporter related protein  63.37 
 
 
316 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.815425  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  63.49 
 
 
304 aa  355  6.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  62.16 
 
 
304 aa  344  8e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0975  ABC transporter related  60.94 
 
 
391 aa  342  5e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06860  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.87 
 
 
323 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3977  ABC transporter related  46.26 
 
 
315 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  50.45 
 
 
318 aa  209  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.82 
 
 
317 aa  183  3e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.15 
 
 
317 aa  181  2e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  32.57 
 
 
305 aa  176  3e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  41.44 
 
 
309 aa  175  7e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  32.45 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.82 
 
 
317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.46 
 
 
236 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.69 
 
 
316 aa  166  4e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  33.67 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  33.67 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 
310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.67 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  33.67 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  33.78 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  34.39 
 
 
306 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
331 aa  163  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
311 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.14 
 
 
309 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 
293 aa  162  9e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  37.67 
 
 
304 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.14 
 
 
309 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1438  ABC transporter, ATPase subunit  35.41 
 
 
310 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.47 
 
 
314 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  32.35 
 
 
298 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  40.89 
 
 
316 aa  161  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  42.49 
 
 
332 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  36.68 
 
 
235 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.79 
 
 
313 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  32.79 
 
 
313 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
266 aa  160  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33 
 
 
303 aa  160  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  39.48 
 
 
244 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.19 
 
 
301 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  35.57 
 
 
310 aa  160  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  41.15 
 
 
310 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
318 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
309 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  39.41 
 
 
301 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  32.79 
 
 
313 aa  159  4e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.44 
 
 
308 aa  159  4e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  32.66 
 
 
303 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  42.4 
 
 
287 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4276  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
303 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.258754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  35.23 
 
 
310 aa  159  6e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  39.91 
 
 
304 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.56 
 
 
303 aa  158  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  30.51 
 
 
307 aa  158  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  40.77 
 
 
305 aa  158  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  32.24 
 
 
309 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.34 
 
 
312 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  41.7 
 
 
247 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.21 
 
 
306 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.96 
 
 
316 aa  156  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  35.92 
 
 
309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  36.47 
 
 
350 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  28.71 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.41 
 
 
301 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  38.03 
 
 
310 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.44 
 
 
333 aa  154  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  35.91 
 
 
341 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  39.92 
 
 
310 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  32.77 
 
 
302 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 
330 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  31.15 
 
 
327 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  31.99 
 
 
303 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  35.68 
 
 
331 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.64 
 
 
308 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  38.86 
 
 
340 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  30.51 
 
 
307 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  34.75 
 
 
311 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.09 
 
 
301 aa  154  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.79 
 
 
315 aa  154  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  36.84 
 
 
323 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4734  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.05 
 
 
334 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.89 
 
 
328 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
308 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  38.05 
 
 
322 aa  154  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.85 
 
 
310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.47 
 
 
312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2235  ABC transporter related protein  43.9 
 
 
334 aa  153  4e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461241  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  40.8 
 
 
303 aa  153  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  40.69 
 
 
331 aa  153  4e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
309 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 
309 aa  153  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  37.31 
 
 
300 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>