More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2875 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  100 
 
 
315 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  68.69 
 
 
340 aa  462  1e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  54.55 
 
 
318 aa  348  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  47.44 
 
 
309 aa  296  4e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  45.83 
 
 
309 aa  292  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  47.6 
 
 
316 aa  292  6e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  46.33 
 
 
337 aa  289  4e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  46.65 
 
 
316 aa  288  9e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  43.59 
 
 
313 aa  239  5e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 
303 aa  224  2e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.64 
 
 
305 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.35 
 
 
327 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  47.86 
 
 
301 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  45.95 
 
 
356 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.28 
 
 
303 aa  212  5.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1642  ABC transporter related  39.48 
 
 
301 aa  208  8e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0749423 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1333  ABC transporter related  36.22 
 
 
315 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.573564  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  46.4 
 
 
300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.48 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  46.12 
 
 
301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  35.37 
 
 
325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  45.15 
 
 
300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
308 aa  197  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  44.59 
 
 
309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  36.72 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  45.29 
 
 
319 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  43.89 
 
 
311 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  45.45 
 
 
318 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.84 
 
 
334 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  33.97 
 
 
314 aa  194  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
305 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
309 aa  192  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
309 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 
305 aa  193  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  44.59 
 
 
309 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  34.19 
 
 
373 aa  191  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  43.24 
 
 
306 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  35.41 
 
 
305 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  43.69 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  43.69 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  33.65 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  43.46 
 
 
241 aa  189  5e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  43.38 
 
 
313 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  35.41 
 
 
305 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.65 
 
 
305 aa  189  8e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
302 aa  187  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.67 
 
 
303 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2043  ABC transporter related  45.02 
 
 
311 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.289791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.29 
 
 
332 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  41.96 
 
 
321 aa  187  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 
305 aa  187  3e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  41.82 
 
 
304 aa  186  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  42.92 
 
 
313 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  34.75 
 
 
305 aa  187  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
302 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
308 aa  186  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0253  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  42.79 
 
 
309 aa  186  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  35.39 
 
 
307 aa  186  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  34.65 
 
 
305 aa  186  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 
305 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  34.32 
 
 
305 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  36.63 
 
 
305 aa  186  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  40.36 
 
 
318 aa  185  7e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.01 
 
 
333 aa  185  7e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.95 
 
 
298 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  42.47 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  34.39 
 
 
316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  35.28 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.06 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.68 
 
 
304 aa  183  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  40.51 
 
 
310 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  36.62 
 
 
304 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  40.62 
 
 
245 aa  183  3e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  33.01 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0659  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.785437 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2058  ABC transporter, ATPase subunit  35.03 
 
 
291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.74 
 
 
310 aa  182  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
311 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  38.11 
 
 
337 aa  181  1e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.4 
 
 
312 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  32.5 
 
 
312 aa  181  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  39.68 
 
 
318 aa  180  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  32.9 
 
 
303 aa  181  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  42.53 
 
 
315 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.74 
 
 
317 aa  181  2e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.9 
 
 
348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  31.39 
 
 
335 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.52 
 
 
330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.95 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.99 
 
 
317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  34.09 
 
 
316 aa  179  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.55 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  34.52 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  32.25 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  40.91 
 
 
331 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.12 
 
 
339 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  40.91 
 
 
303 aa  179  7e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>