More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3749 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  100 
 
 
310 aa  626  1e-178  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  44.7 
 
 
326 aa  258  7e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  44.98 
 
 
292 aa  256  4e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  43.71 
 
 
326 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  44.97 
 
 
325 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4399  ABC transporter related  47.27 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.104293  normal  0.447508 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  40 
 
 
305 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  50.49 
 
 
318 aa  228  7e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  50.49 
 
 
318 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  49.51 
 
 
318 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  49.11 
 
 
367 aa  227  2e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3286  ABC transporter-like  49.41 
 
 
330 aa  223  4.9999999999999996e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  41.55 
 
 
288 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  43.71 
 
 
296 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1062  ABC transporter-like protein protein  48.11 
 
 
326 aa  219  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.124744  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  37.84 
 
 
339 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  47.25 
 
 
309 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  40.42 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  47.09 
 
 
287 aa  209  4e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  43.72 
 
 
247 aa  205  6e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  47 
 
 
302 aa  205  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  46.12 
 
 
287 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2675  ABC transporter related  41.06 
 
 
247 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  39.53 
 
 
300 aa  203  3e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  43.43 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  43.36 
 
 
304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  36.57 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  42.04 
 
 
315 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  43.83 
 
 
310 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  44.54 
 
 
356 aa  192  5e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  42.26 
 
 
310 aa  192  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  37.17 
 
 
298 aa  190  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 
338 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.67 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  40.87 
 
 
306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  38.98 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  43.61 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  37.36 
 
 
323 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0381  ABC transporter related  40.33 
 
 
331 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.702756  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  35.37 
 
 
311 aa  180  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  38.06 
 
 
321 aa  181  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  42.67 
 
 
313 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  38.53 
 
 
341 aa  180  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  40.61 
 
 
314 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  40.4 
 
 
322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  35.58 
 
 
313 aa  179  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  42.04 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.84 
 
 
337 aa  179  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  37.74 
 
 
328 aa  177  1e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  34.94 
 
 
313 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  42.36 
 
 
340 aa  178  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  35.76 
 
 
350 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 
305 aa  177  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.96 
 
 
308 aa  176  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 
313 aa  176  6e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  40.74 
 
 
316 aa  176  6e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
305 aa  175  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  39.37 
 
 
309 aa  175  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  36.93 
 
 
290 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  34.91 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  41.78 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  40.97 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1807  ABC transporter related  37.8 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.896486  normal  0.83976 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  40.42 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  41.23 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  40.42 
 
 
310 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.76 
 
 
279 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  39.47 
 
 
305 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  40.69 
 
 
316 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  30.75 
 
 
324 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  39.73 
 
 
326 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  33.55 
 
 
302 aa  172  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.08 
 
 
309 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1171  ABC transporter related protein  41.07 
 
 
230 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  43.39 
 
 
304 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
360 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  37.6 
 
 
318 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  37.5 
 
 
328 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  41.38 
 
 
295 aa  171  2e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  43.39 
 
 
304 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  36.75 
 
 
328 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  34.44 
 
 
305 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
244 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  37.45 
 
 
327 aa  170  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  35.39 
 
 
298 aa  170  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  40.78 
 
 
305 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 
330 aa  170  4e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.75 
 
 
305 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  37.79 
 
 
309 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  40.5 
 
 
304 aa  169  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  37.94 
 
 
314 aa  169  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  39.53 
 
 
301 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  36.6 
 
 
308 aa  169  6e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.66 
 
 
305 aa  169  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  42.05 
 
 
300 aa  169  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  37.27 
 
 
303 aa  169  8e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
318 aa  168  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.64 
 
 
305 aa  168  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>