More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3143 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  100 
 
 		 274 aa  567  1e-160  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  51.85 
 
 		 246 aa  252  5.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  45.77 
 
 		 251 aa  245  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  45.27 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  44.86 
 
 		 243 aa  230  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  45.27 
 
 		 252 aa  224  1e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  43.56 
 
 		 240 aa  219  5e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  45.27 
 
 		 248 aa  216  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  44.21 
 
 		 241 aa  216  4e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  41.47 
 
 		 258 aa  214  9e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 285 aa  208  9e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  42.23 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  41.15 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  49.74 
 
 		 260 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  44.67 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  39.68 
 
 		 251 aa  197  2.0000000000000003e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40.07 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  45.54 
 
 		 344 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 		 248 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  41.43 
 
 		 248 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.63 
 
 		 328 aa  195  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.2 
 
 		 259 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  41.59 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  39.42 
 
 		 244 aa  192  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  40.52 
 
 		 298 aa  192  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  40.87 
 
 		 316 aa  191  8e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 341 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  40.5 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 328 aa  191  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  40 
 
 		 295 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.36 
 
 		 334 aa  190  2e-47  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 253 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.56 
 
 		 282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  39.83 
 
 		 244 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  41.63 
 
 		 240 aa  189  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  39.51 
 
 		 252 aa  188  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.84 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  39.38 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  39.73 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  41.52 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  37.83 
 
 		 332 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  36.9 
 
 		 510 aa  186  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  186  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  185  5e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  186  5e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  41.84 
 
 		 330 aa  185  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 		 247 aa  185  6e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 		 262 aa  185  7e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  38.05 
 
 		 296 aa  185  8e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  37.76 
 
 		 244 aa  185  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  38.17 
 
 		 244 aa  185  9e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 		 245 aa  185  9e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  38.27 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  36.6 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  40.74 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.91 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.87 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.86 
 
 		 319 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  37.34 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 321 aa  183  3e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  37.01 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.39 
 
 		 309 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  37.01 
 
 		 250 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  35.22 
 
 		 247 aa  181  9.000000000000001e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  38.17 
 
 		 244 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  37.5 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  37.2 
 
 		 512 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  39.91 
 
 		 326 aa  180  2e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.63 
 
 		 324 aa  180  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 311 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 		 327 aa  179  4e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  36.47 
 
 		 593 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  36.4 
 
 		 249 aa  179  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  38.26 
 
 		 333 aa  178  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.94 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  36.84 
 
 		 293 aa  178  8e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.34 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  35.42 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  38.26 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  34.12 
 
 		 582 aa  177  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.94 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.71 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  39.83 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  41.47 
 
 		 330 aa  176  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  37.39 
 
 		 307 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.4 
 
 		 323 aa  176  3e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  40.78 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 		 324 aa  176  4e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  39.39 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  39.18 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  39.39 
 
 		 244 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>