More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3873 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  100 
 
 		 248 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  79.03 
 
 		 248 aa  402  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  74.19 
 
 		 248 aa  380  1e-104  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  73.79 
 
 		 248 aa  379  1e-104  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  53.23 
 
 		 244 aa  285  2.9999999999999996e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  51.61 
 
 		 244 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  53.63 
 
 		 244 aa  279  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  52.02 
 
 		 244 aa  277  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  52.82 
 
 		 244 aa  277  9e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  51.39 
 
 		 251 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  52.82 
 
 		 244 aa  276  2e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  52.42 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  52.42 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  52.42 
 
 		 244 aa  276  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  52.02 
 
 		 244 aa  274  9e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  51.61 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  52.82 
 
 		 244 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  51.61 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  51.61 
 
 		 244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  51.61 
 
 		 244 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3800  sodium ABC transporter ATP-binding protein  54.3 
 
 		 262 aa  271  5.000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.939362  hitchhiker  0.00685635 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  51.61 
 
 		 244 aa  271  6e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1528  ABC transporter related  50.21 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.479266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  44.63 
 
 		 251 aa  223  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  46.93 
 
 		 260 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  42.21 
 
 		 243 aa  216  4e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  42.21 
 
 		 243 aa  215  5e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  42.73 
 
 		 241 aa  208  8e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  42.23 
 
 		 274 aa  207  9e-53  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  46.45 
 
 		 273 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3195  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 285 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  40.24 
 
 		 252 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  39.83 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  40.59 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  40.35 
 
 		 295 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  40.25 
 
 		 295 aa  179  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  40 
 
 		 258 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 356 aa  175  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1675  ABC transporter related  39.17 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  39.66 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  37.55 
 
 		 293 aa  174  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  39.04 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  39.83 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.98 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  40.08 
 
 		 332 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 		 252 aa  172  5e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  40 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  34.65 
 
 		 290 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.53 
 
 		 330 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  40.09 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40.09 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  35.1 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.91 
 
 		 312 aa  169  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  39.08 
 
 		 309 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.14 
 
 		 309 aa  168  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  36.73 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  40.38 
 
 		 337 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  36.32 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  41.23 
 
 		 337 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  35.17 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  39.41 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  38.98 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  34.69 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  34.69 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 241 aa  166  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  41.2 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 		 576 aa  166  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  35.34 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4160  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.65 
 
 		 339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.144366 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  34.29 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  42.11 
 
 		 337 aa  166  4e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3736  Na+ extrusion transport system ATP-binding protein  37.66 
 
 		 249 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.46 
 
 		 245 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 241 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2148  ATPase  40.62 
 
 		 340 aa  165  5e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.96125  normal  0.315511 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  37.86 
 
 		 250 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 305 aa  165  5.9999999999999996e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  34.55 
 
 		 325 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  36.56 
 
 		 306 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.51 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.51 
 
 		 250 aa  164  9e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.65 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  37.45 
 
 		 261 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  38.94 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  41.18 
 
 		 314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.66 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  39.29 
 
 		 299 aa  163  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  40.65 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.05 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 321 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  38.77 
 
 		 339 aa  163  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  34.68 
 
 		 583 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  33.33 
 
 		 239 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  39.52 
 
 		 328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  38.58 
 
 		 253 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 308 aa  162  7e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>