More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1689 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
252 aa  511  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  61 
 
 
242 aa  311  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  60.67 
 
 
244 aa  305  7e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  60.25 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
241 aa  304  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  60.25 
 
 
241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  58.58 
 
 
241 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  59.41 
 
 
241 aa  298  7e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  53.94 
 
 
240 aa  276  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  52.48 
 
 
241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  52.48 
 
 
241 aa  273  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  53.72 
 
 
239 aa  271  9e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  50.42 
 
 
250 aa  259  3e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  46.69 
 
 
237 aa  249  3e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  48.96 
 
 
236 aa  246  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  48.52 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  48.1 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
238 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  49.16 
 
 
246 aa  230  2e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  48.32 
 
 
247 aa  229  3e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  45.8 
 
 
244 aa  227  2e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  45.61 
 
 
257 aa  223  2e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  48.13 
 
 
249 aa  222  4.9999999999999996e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  43.75 
 
 
259 aa  221  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  45.68 
 
 
414 aa  221  7e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  43.33 
 
 
247 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  44.63 
 
 
253 aa  216  2e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  45.19 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  45.19 
 
 
250 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.26 
 
 
250 aa  209  3e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.18 
 
 
243 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  41.56 
 
 
245 aa  207  9e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  40.66 
 
 
247 aa  199  3.9999999999999996e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  42.02 
 
 
256 aa  198  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  41.2 
 
 
249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  39.83 
 
 
246 aa  196  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  39.91 
 
 
249 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  41.49 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  42.51 
 
 
256 aa  194  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  39.57 
 
 
238 aa  192  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
247 aa  192  4e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  39.33 
 
 
258 aa  191  7e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
259 aa  191  8e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  44.6 
 
 
325 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.49 
 
 
309 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
274 aa  188  9e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  39.55 
 
 
325 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  38.27 
 
 
250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  40.73 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  42.52 
 
 
369 aa  181  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  38.43 
 
 
241 aa  181  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  40.72 
 
 
305 aa  181  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.08 
 
 
240 aa  180  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  36.4 
 
 
243 aa  180  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  38.5 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
308 aa  178  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.93 
 
 
314 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 
321 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 
308 aa  177  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.69 
 
 
311 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  38.12 
 
 
299 aa  176  4e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0768  ABC transporter related protein  38.6 
 
 
255 aa  176  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.23 
 
 
312 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  41.4 
 
 
304 aa  175  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  38.66 
 
 
237 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  36.18 
 
 
266 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  38.46 
 
 
512 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.44 
 
 
411 aa  173  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  39.37 
 
 
334 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  36.28 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.22 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.82 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.01 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 
238 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.33 
 
 
317 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.01 
 
 
326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  40 
 
 
287 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  38.43 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  38.91 
 
 
338 aa  172  3.9999999999999995e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  36.93 
 
 
248 aa  172  5e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  36.64 
 
 
317 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  38.36 
 
 
253 aa  172  6.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
266 aa  171  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 
310 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.29 
 
 
328 aa  171  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  37.78 
 
 
318 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.75 
 
 
303 aa  171  9e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  37.56 
 
 
344 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1791  ABC transporter-like protein  38.43 
 
 
240 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 
305 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  37.82 
 
 
305 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  35.92 
 
 
252 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  35.75 
 
 
314 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  34.98 
 
 
316 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>