More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1572 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
243 aa  494  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  77.82 
 
 
241 aa  386  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  66.94 
 
 
256 aa  347  1e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  60.42 
 
 
245 aa  314  9e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  58.09 
 
 
247 aa  295  6e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  56.07 
 
 
246 aa  291  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  56.07 
 
 
246 aa  291  5e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  56.85 
 
 
247 aa  291  7e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  56.85 
 
 
247 aa  290  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  56.85 
 
 
247 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  56.85 
 
 
247 aa  290  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  56.85 
 
 
247 aa  290  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
247 aa  289  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  56.85 
 
 
247 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
246 aa  288  4e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  56.43 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
247 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  56.02 
 
 
247 aa  287  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  56.43 
 
 
245 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  56.07 
 
 
245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1274  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.48 
 
 
244 aa  244  8e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1443  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.7 
 
 
248 aa  244  9e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000394944  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1227  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.11 
 
 
246 aa  229  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2498  ABC transporter related  42.86 
 
 
236 aa  189  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  42.79 
 
 
237 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2012  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
236 aa  181  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763629  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  36.82 
 
 
240 aa  181  7e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1634  ABC transporter-related protein  38.02 
 
 
257 aa  181  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00322999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2256  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
236 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.19395e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2011  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
236 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 
252 aa  180  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2073  ABC transporter ATP-binding protein  38.84 
 
 
236 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.547157  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2212  ABC transporter, ATP-binding protein  38.43 
 
 
236 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2228  ABC transporter ATP-binding protein  38.84 
 
 
236 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2052  ABC transporter related  37.6 
 
 
240 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2258  ABC transporter, ATP-binding protein  37.19 
 
 
236 aa  175  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2340  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
236 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.711037  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.67 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
253 aa  174  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.71 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  38.02 
 
 
257 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  36.36 
 
 
250 aa  170  2e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  39.11 
 
 
256 aa  170  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  36.51 
 
 
246 aa  168  6e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 
266 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 
245 aa  167  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  36.97 
 
 
256 aa  167  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  37.3 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  36.77 
 
 
237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  37.5 
 
 
258 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  37.17 
 
 
236 aa  162  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  36.7 
 
 
259 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 
242 aa  159  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.57 
 
 
241 aa  159  4e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.56 
 
 
247 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.62 
 
 
332 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  38.84 
 
 
293 aa  158  9e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1477  ABC transporter related  36.71 
 
 
262 aa  158  9e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.67 
 
 
249 aa  157  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.1 
 
 
344 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  34.16 
 
 
259 aa  157  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  35.48 
 
 
241 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  35.78 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  33.74 
 
 
241 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  35.78 
 
 
250 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  34.78 
 
 
252 aa  155  6e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  34.18 
 
 
311 aa  155  7e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  32.64 
 
 
239 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  35.37 
 
 
249 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
250 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  34.08 
 
 
310 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 
312 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
312 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 
312 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 
312 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 
312 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  34.02 
 
 
247 aa  153  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  34.84 
 
 
251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 
241 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
241 aa  152  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
241 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
241 aa  152  4e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  34.71 
 
 
241 aa  152  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.82 
 
 
291 aa  152  4e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 
312 aa  152  4e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
310 aa  152  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
241 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 
312 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 
312 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  31.67 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.59 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
241 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  38.18 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.2 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  34.02 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
244 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  34.06 
 
 
305 aa  151  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  34.18 
 
 
244 aa  151  8e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>