More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1678 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  73.64 
 
 
244 aa  382  1e-105  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  51.26 
 
 
241 aa  259  2e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  51.26 
 
 
241 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  45.64 
 
 
241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  44.96 
 
 
242 aa  226  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
241 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
241 aa  224  1e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  45.23 
 
 
244 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 
241 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  44.81 
 
 
241 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
241 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
241 aa  222  4e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
241 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  44.81 
 
 
241 aa  222  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  43.85 
 
 
250 aa  222  4e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  44.81 
 
 
241 aa  221  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  42.8 
 
 
237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
252 aa  209  3e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  42.19 
 
 
240 aa  204  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  39.41 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  42.26 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  40.51 
 
 
239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
238 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.17 
 
 
257 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  40.43 
 
 
238 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  39.91 
 
 
308 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  40 
 
 
414 aa  191  7e-48  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  40.34 
 
 
247 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  36.4 
 
 
249 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.44 
 
 
250 aa  188  5e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.44 
 
 
250 aa  188  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  38.4 
 
 
246 aa  188  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.97 
 
 
245 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  40 
 
 
247 aa  181  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  39 
 
 
256 aa  180  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
250 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.37 
 
 
279 aa  175  4e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  32.78 
 
 
253 aa  176  4e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.95 
 
 
256 aa  176  4e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  34.87 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
251 aa  171  6.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  35.44 
 
 
258 aa  171  9e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
247 aa  171  9e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 
246 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
256 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  35.29 
 
 
247 aa  168  8e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
247 aa  167  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  34.03 
 
 
245 aa  167  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 
247 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  35.29 
 
 
247 aa  166  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  34.6 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  34.6 
 
 
246 aa  166  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  34.87 
 
 
247 aa  166  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  34.87 
 
 
247 aa  166  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 
247 aa  164  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  34.87 
 
 
247 aa  164  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  32.08 
 
 
274 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  34.45 
 
 
247 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 
247 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  36.13 
 
 
314 aa  162  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  33.47 
 
 
245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  34.58 
 
 
311 aa  162  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  32.7 
 
 
369 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  34.03 
 
 
247 aa  160  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  34.04 
 
 
250 aa  160  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  34.21 
 
 
297 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  34.47 
 
 
305 aa  160  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  35.44 
 
 
266 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.94 
 
 
279 aa  160  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  35.98 
 
 
270 aa  159  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  36.02 
 
 
242 aa  159  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  32.88 
 
 
310 aa  159  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.05 
 
 
328 aa  159  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  33.91 
 
 
301 aa  158  6e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  30.99 
 
 
243 aa  158  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  31.4 
 
 
243 aa  158  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.38 
 
 
328 aa  158  8e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.53 
 
 
300 aa  157  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  35.65 
 
 
252 aa  157  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  35.54 
 
 
243 aa  156  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  35.86 
 
 
237 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  36.32 
 
 
303 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  35.19 
 
 
316 aa  157  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  33.18 
 
 
317 aa  156  3e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  33.78 
 
 
344 aa  156  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.29 
 
 
303 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
244 aa  156  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  34.33 
 
 
293 aa  155  4e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
309 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  34.09 
 
 
236 aa  155  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.78 
 
 
309 aa  155  6e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.22 
 
 
319 aa  155  7e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  34.86 
 
 
301 aa  155  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
317 aa  155  7e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  37.79 
 
 
298 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>