More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1372 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  500  1e-141  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  85.31 
 
 		 246 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  85.31 
 
 		 246 aa  436  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  60.08 
 
 		 247 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.67 
 
 		 256 aa  305  3e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  59.24 
 
 		 247 aa  305  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  58.82 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  58.82 
 
 		 247 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  58.51 
 
 		 245 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  58.82 
 
 		 247 aa  302  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  58.82 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 247 aa  301  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  58.82 
 
 		 247 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  58.82 
 
 		 247 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  58.82 
 
 		 247 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  57.56 
 
 		 247 aa  298  6e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 245 aa  294  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  53.11 
 
 		 245 aa  289  2e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  54.39 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  54.62 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1274  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.5 
 
 		 244 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1443  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.03 
 
 		 248 aa  232  4.0000000000000004e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000394944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1227  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.28 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2498  ABC transporter related  46.32 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673137  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2052  ABC transporter related  42.36 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2011  ABC transporter, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 236 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2258  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2340  ABC transporter, ATP-binding protein  41.48 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.711037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2012  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2212  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2256  ABC transporter, ATP-binding protein  41.92 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.19395e-27 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2073  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.547157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1634  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 257 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00322999  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2228  ABC transporter ATP-binding protein  41.92 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  40.17 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.24 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.45 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.86 
 
 		 243 aa  170  2e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  35.25 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  41.15 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  36.78 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  34.73 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  30.61 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.87 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.62 
 
 		 297 aa  155  4e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.42 
 
 		 250 aa  156  4e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  37.44 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  33.76 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  37.22 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  33.61 
 
 		 258 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  32.61 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  33.06 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  33.61 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  34.02 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.82 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  36.13 
 
 		 236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.51 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  34.67 
 
 		 316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  32.2 
 
 		 253 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  33.06 
 
 		 249 aa  152  7e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  34.03 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.53 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  34.03 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  33.93 
 
 		 237 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  36.65 
 
 		 319 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  35.24 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1530  ABC transporter related  35.62 
 
 		 304 aa  150  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.653437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  37.67 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  34.98 
 
 		 332 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 241 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  32.08 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.78 
 
 		 344 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  35.68 
 
 		 296 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  31.22 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.75 
 
 		 308 aa  148  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 244 aa  148  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  33.61 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  32.64 
 
 		 243 aa  148  9e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  35.68 
 
 		 296 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  33.33 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  34.53 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  35.75 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  37.33 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3333  ABC transporter related  35.98 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  35.9 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  34.98 
 
 		 332 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  32.38 
 
 		 315 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  33.62 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  33.62 
 
 		 250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  38.24 
 
 		 288 aa  146  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  36.32 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  32.91 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>