More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2278 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 256 aa  519  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  67.78 
 
 		 241 aa  351  8e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  66.94 
 
 		 243 aa  347  1e-94  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0815  ABC transporter-related protein  62.76 
 
 		 247 aa  323  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0968  ABC transporter, ATP-binding protein  61.92 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1084  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  61.92 
 
 		 247 aa  320  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4220  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  61.92 
 
 		 247 aa  319  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.183421  normal  0.0669124 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1213  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  61.51 
 
 		 247 aa  319  3e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1152  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  61.51 
 
 		 247 aa  318  6e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0979  ABC transporter ATP-binding protein EcsA  61.51 
 
 		 247 aa  317  9e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1048  ABC transporter ATP-binding protein  61.51 
 
 		 247 aa  317  9e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1125  ABC transporter, ATP-binding protein EcsA  61.51 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0958  ABC transporter, ATP-binding protein  61.51 
 
 		 247 aa  317  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  61.09 
 
 		 247 aa  317  2e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1924  ABC transporter related  60.25 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.717328  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1890  ABC transporter related  60.25 
 
 		 246 aa  310  1e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.670859  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1372  ABC transporter, ATP-binding protein  56.67 
 
 		 246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00133001  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1262  ABC transporter related  57.5 
 
 		 245 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000313912  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0645  ABC transporter related  59 
 
 		 245 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  55.97 
 
 		 245 aa  285  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1274  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 244 aa  250  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1443  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.28 
 
 		 248 aa  231  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000394944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1227  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.78 
 
 		 246 aa  229  5e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0707636  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2498  ABC transporter related  45.89 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00673137  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  42.68 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2212  ABC transporter, ATP-binding protein  42.24 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2012  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0763629  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2052  ABC transporter related  41.81 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.226439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1634  ABC transporter-related protein  39.58 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00322999  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2256  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.19395e-27 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2011  ABC transporter, ATP-binding protein  41.38 
 
 		 236 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2258  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0519  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2073  ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.547157  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2228  ABC transporter ATP-binding protein  40.26 
 
 		 236 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  37.66 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  36.1 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2340  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 236 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.711037  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.95 
 
 		 243 aa  176  5e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.1 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  35 
 
 		 252 aa  169  4e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  33.47 
 
 		 240 aa  169  4e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  38.71 
 
 		 256 aa  166  4e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 244 aa  165  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  35.56 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  35.54 
 
 		 243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.2 
 
 		 246 aa  161  7e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  35.43 
 
 		 249 aa  161  8.000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.73 
 
 		 308 aa  161  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  36.13 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  35.83 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 		 259 aa  159  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 266 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  35.56 
 
 		 250 aa  158  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  35.29 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  36.02 
 
 		 238 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 310 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  34.98 
 
 		 249 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.87 
 
 		 310 aa  155  6e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  35.86 
 
 		 244 aa  155  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1477  ABC transporter related  36.93 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.226927  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  34.87 
 
 		 256 aa  154  9e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  36.02 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 312 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 238 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  33.33 
 
 		 239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  35.44 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  31.74 
 
 		 294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  36.65 
 
 		 250 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  36.61 
 
 		 250 aa  152  4e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 312 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  32.8 
 
 		 295 aa  152  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 312 aa  152  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  35.44 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  35.91 
 
 		 312 aa  152  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  35.44 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  35.44 
 
 		 244 aa  152  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.63 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  34.03 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  33.04 
 
 		 241 aa  151  8.999999999999999e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  34.03 
 
 		 250 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  32.17 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  32.6 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  32.88 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.15 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  36 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  35.56 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  34.6 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  34.6 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  34.6 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  35.44 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  36.17 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  36.82 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  35.44 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>