More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1795 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  100 
 
 		 294 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  94.22 
 
 		 297 aa  542  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  65.17 
 
 		 291 aa  376  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  64.04 
 
 		 292 aa  371  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  66.44 
 
 		 303 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  66.44 
 
 		 305 aa  349  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  60.2 
 
 		 295 aa  331  8e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  59.86 
 
 		 326 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  55.97 
 
 		 326 aa  308  6.999999999999999e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  56.42 
 
 		 341 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  54.79 
 
 		 406 aa  296  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  56.61 
 
 		 317 aa  288  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  53.57 
 
 		 318 aa  286  2.9999999999999996e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  54.45 
 
 		 307 aa  285  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  54.08 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  52.74 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  55.41 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  54.61 
 
 		 292 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  51.19 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 298 aa  268  1e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  49.49 
 
 		 303 aa  268  1e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  35.86 
 
 		 299 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.84 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  35.15 
 
 		 298 aa  199  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.69 
 
 		 301 aa  195  8.000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  34.12 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.45 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  34.12 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.84 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  36.3 
 
 		 299 aa  190  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  35.02 
 
 		 296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.54 
 
 		 297 aa  182  6e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 296 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.68 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  32 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.74 
 
 		 298 aa  176  4e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 		 294 aa  176  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  37.5 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  33.88 
 
 		 312 aa  175  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  32.87 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  32.67 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  32.88 
 
 		 294 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  32.88 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  31.96 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  29.25 
 
 		 321 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  32.08 
 
 		 294 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  31.83 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.14 
 
 		 316 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  32.31 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  33.48 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  30 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.45 
 
 		 315 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  38.64 
 
 		 294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  38.25 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  32.2 
 
 		 294 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  31.83 
 
 		 298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.22 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  30.59 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  29.29 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  34.56 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  33.66 
 
 		 266 aa  155  8e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 		 241 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.74 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  34.64 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.34 
 
 		 312 aa  152  8.999999999999999e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.89 
 
 		 331 aa  151  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  37.19 
 
 		 344 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.41 
 
 		 325 aa  149  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  37.29 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  37.29 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  31.22 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.64 
 
 		 329 aa  149  5e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  27.98 
 
 		 266 aa  149  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.71 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  30.04 
 
 		 299 aa  149  6e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  30.8 
 
 		 258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  36.86 
 
 		 306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 		 306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  39.32 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  35.51 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0963  ABC transporter related  32.74 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  33.21 
 
 		 319 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  34.84 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 243 aa  147  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  30.63 
 
 		 302 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  35.53 
 
 		 235 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  31.2 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  38.57 
 
 		 304 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  38.46 
 
 		 360 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0298  ABC transporter related protein  42.42 
 
 		 367 aa  144  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  33.9 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.323648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>