More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3473 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  100 
 
 
315 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  68.03 
 
 
294 aa  422  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  65.33 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  37.58 
 
 
300 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.95 
 
 
299 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.9 
 
 
298 aa  209  6e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  34.58 
 
 
298 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 
305 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.88 
 
 
298 aa  204  2e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
294 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
294 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
299 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36.3 
 
 
303 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36.3 
 
 
303 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 
294 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.1 
 
 
315 aa  195  7e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 
308 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  35.62 
 
 
294 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.85 
 
 
321 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  37.63 
 
 
299 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  37.63 
 
 
299 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  36.11 
 
 
292 aa  194  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  35.62 
 
 
303 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 
294 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  37.2 
 
 
406 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  34.48 
 
 
294 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  34.59 
 
 
294 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  37.46 
 
 
307 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  34.87 
 
 
341 aa  186  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  37.46 
 
 
326 aa  185  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  39 
 
 
303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  39.63 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  33.91 
 
 
299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.73 
 
 
291 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  43.13 
 
 
309 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  35.99 
 
 
305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  33.22 
 
 
298 aa  181  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  35.39 
 
 
305 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.79 
 
 
292 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
309 aa  177  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  35.82 
 
 
317 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.67 
 
 
326 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  35.33 
 
 
319 aa  176  5e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  33.76 
 
 
318 aa  176  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
303 aa  175  9e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  33.8 
 
 
296 aa  172  9e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  33.57 
 
 
296 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  33.68 
 
 
290 aa  171  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  36.12 
 
 
309 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  35.4 
 
 
305 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  39.34 
 
 
293 aa  169  8e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  33.33 
 
 
304 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  33.45 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.75 
 
 
297 aa  166  4e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.09 
 
 
309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  30.14 
 
 
301 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  32.76 
 
 
297 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  35.71 
 
 
309 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  30.58 
 
 
296 aa  159  4e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.97 
 
 
309 aa  159  4e-38  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  32.25 
 
 
312 aa  159  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.77 
 
 
298 aa  159  6e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  33.45 
 
 
295 aa  156  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  31.94 
 
 
302 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  34.33 
 
 
310 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  33.67 
 
 
332 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
310 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
326 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  33.33 
 
 
304 aa  152  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  30.46 
 
 
341 aa  153  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  31.14 
 
 
295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  32.12 
 
 
310 aa  152  7e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.18 
 
 
324 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  33.54 
 
 
314 aa  152  7e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  36.94 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  32.49 
 
 
297 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  34.01 
 
 
373 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  31.05 
 
 
306 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  32.88 
 
 
320 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  30.62 
 
 
305 aa  148  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  31.56 
 
 
353 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  32.48 
 
 
339 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  32.26 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  35.43 
 
 
337 aa  148  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  29.77 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  31.48 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  37.44 
 
 
593 aa  147  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.71 
 
 
319 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  32.66 
 
 
304 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  32.34 
 
 
293 aa  147  3e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  30.49 
 
 
304 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  33.85 
 
 
316 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.67 
 
 
312 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  32.58 
 
 
541 aa  146  5e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  32.33 
 
 
326 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>