More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0485 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 301 aa  612  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  44.82 
 
 		 304 aa  269  5e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  44.23 
 
 		 309 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  43.48 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  44.13 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  43.19 
 
 		 321 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 		 309 aa  258  7e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 		 319 aa  257  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  41.67 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 		 305 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  38.57 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  38.57 
 
 		 299 aa  224  2e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.57 
 
 		 299 aa  222  6e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  39 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  37.88 
 
 		 299 aa  215  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.93 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  34 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  33.44 
 
 		 298 aa  210  3e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  43.35 
 
 		 294 aa  209  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.78 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.12 
 
 		 300 aa  208  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  42.11 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  36.58 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  39.07 
 
 		 294 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.3 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.86 
 
 		 309 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  38.61 
 
 		 294 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  39.4 
 
 		 294 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  37.83 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  34.69 
 
 		 294 aa  195  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  33.67 
 
 		 293 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 		 303 aa  195  9e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 		 294 aa  195  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  39.07 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  42.53 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  39.07 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 296 aa  194  2e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  38.41 
 
 		 294 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.01 
 
 		 292 aa  192  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.91 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  34.01 
 
 		 297 aa  192  8e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  34.11 
 
 		 318 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  32.21 
 
 		 406 aa  189  4e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  32.77 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  33.79 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  41.4 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  32.8 
 
 		 303 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  32.42 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.16 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.89 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  38.81 
 
 		 293 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.56 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  32.07 
 
 		 341 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 298 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  31.77 
 
 		 326 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.21 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  33 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  32.57 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  38.94 
 
 		 294 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 266 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  38.1 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  34.73 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  32.75 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  30.14 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 		 305 aa  159  4e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 312 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  34.56 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.12 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  36 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  36.97 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2447  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  34.25 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.436893  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0076  ABC transporter related  33.64 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  33.77 
 
 		 240 aa  150  3e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  29.43 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 341 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  33.73 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  35.17 
 
 		 266 aa  149  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4957  ABC transporter related  32.77 
 
 		 256 aa  148  9e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.58 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.34 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  30.61 
 
 		 293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  34.26 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  29.72 
 
 		 314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  28.48 
 
 		 314 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  33.03 
 
 		 298 aa  146  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  34.22 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  29.33 
 
 		 321 aa  146  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  34.54 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  29.96 
 
 		 245 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  36.41 
 
 		 307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  34.72 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  32.74 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  36.11 
 
 		 331 aa  145  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.13 
 
 		 309 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  34.33 
 
 		 369 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>