More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1274 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  100 
 
 		 298 aa  593  1e-168  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  64.85 
 
 		 341 aa  360  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  64.53 
 
 		 326 aa  350  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  62.37 
 
 		 326 aa  348  8e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  63.39 
 
 		 317 aa  342  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  59.93 
 
 		 406 aa  335  7e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  62.42 
 
 		 305 aa  332  3e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  59.73 
 
 		 303 aa  325  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  55.44 
 
 		 290 aa  310  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  55.97 
 
 		 293 aa  308  6.999999999999999e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  59.12 
 
 		 307 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  54.61 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  51.53 
 
 		 297 aa  278  6e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  53.74 
 
 		 305 aa  278  7e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.21 
 
 		 291 aa  277  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  52.88 
 
 		 318 aa  276  4e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  52.05 
 
 		 295 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  50.17 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  50.34 
 
 		 303 aa  264  1e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  48.99 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  44.18 
 
 		 293 aa  242  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.49 
 
 		 299 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  36.61 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  36.61 
 
 		 299 aa  215  5.9999999999999996e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  35.64 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.57 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.33 
 
 		 309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  40.26 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 309 aa  194  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.4 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  36.01 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  34.36 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.44 
 
 		 309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.32 
 
 		 321 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 		 308 aa  189  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.03 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  33.33 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  34.47 
 
 		 298 aa  185  8e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  40.67 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  31.89 
 
 		 301 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  34.98 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  35.23 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  35.12 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.1 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 303 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 266 aa  178  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  34.54 
 
 		 303 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  39.41 
 
 		 304 aa  178  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  34.53 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  35.57 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 319 aa  176  6e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  38.05 
 
 		 309 aa  175  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  31.88 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  37.5 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  39.72 
 
 		 294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  34.11 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  35.43 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.58 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  41.63 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  40.37 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  42.37 
 
 		 344 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.53 
 
 		 245 aa  160  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  40.17 
 
 		 373 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  32.58 
 
 		 316 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  38.14 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  35.02 
 
 		 297 aa  159  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  38.14 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  38.1 
 
 		 918 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  33.22 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  37.87 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  42.66 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  36.65 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.39 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  39.66 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  39.66 
 
 		 320 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  33.18 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  42.13 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  39.35 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  31.98 
 
 		 237 aa  155  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  37.72 
 
 		 252 aa  155  7e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  33.86 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.78 
 
 		 309 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  31.38 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  36.44 
 
 		 360 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 341 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  36.52 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  36.11 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>