More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1946 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  100 
 
 		 309 aa  631  1e-180  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  61.15 
 
 		 297 aa  374  1e-102  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.88 
 
 		 309 aa  319  3.9999999999999996e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.96 
 
 		 298 aa  268  7e-71  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  44.15 
 
 		 299 aa  268  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  39.66 
 
 		 299 aa  245  8e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  40.27 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  40.27 
 
 		 299 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  40.69 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  41.58 
 
 		 298 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  41.53 
 
 		 296 aa  231  2e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  39.46 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.48 
 
 		 326 aa  222  7e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 293 aa  222  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  37.41 
 
 		 326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  39.04 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  37.8 
 
 		 296 aa  215  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.54 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  38.28 
 
 		 294 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  37.24 
 
 		 317 aa  211  9e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  38.97 
 
 		 300 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  37.54 
 
 		 292 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 294 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  39.86 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  40.21 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  39.66 
 
 		 303 aa  210  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  39.66 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 		 319 aa  209  4e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  39.32 
 
 		 294 aa  209  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  36.68 
 
 		 292 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  40.21 
 
 		 294 aa  209  6e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  39.52 
 
 		 303 aa  209  6e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  39.86 
 
 		 303 aa  209  7e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 294 aa  208  9e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  36.15 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  34.6 
 
 		 295 aa  207  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 309 aa  207  3e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  35.47 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  35.79 
 
 		 341 aa  203  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 305 aa  201  9e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  34.36 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  35.08 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  35.84 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  35.84 
 
 		 297 aa  199  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 318 aa  196  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  37.33 
 
 		 298 aa  197  3e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 290 aa  195  8.000000000000001e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  35.86 
 
 		 309 aa  195  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  34.11 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  42.08 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.1 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.87 
 
 		 312 aa  189  4e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  35.56 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  33.55 
 
 		 305 aa  189  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.34 
 
 		 304 aa  189  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.12 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  33.91 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  32.07 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 298 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 266 aa  170  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  36.73 
 
 		 294 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  36.99 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  39.09 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.25 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  33.22 
 
 		 306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.55 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  31.88 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  32.28 
 
 		 311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  35.87 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0452  ABC transporter related protein  31.89 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  32.48 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  30.3 
 
 		 311 aa  144  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  30.45 
 
 		 306 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.3 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  30.16 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  30.56 
 
 		 340 aa  142  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  34.76 
 
 		 248 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  30.87 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.53 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  33.77 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  28.48 
 
 		 308 aa  142  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.28 
 
 		 243 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  32.77 
 
 		 332 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.01 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  32.89 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.3 
 
 		 305 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  32.41 
 
 		 297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  34 
 
 		 248 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  30.72 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  32.04 
 
 		 300 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  30.27 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  36.19 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  29.49 
 
 		 332 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  33.22 
 
 		 293 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>