More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4174 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  100 
 
 		 295 aa  567  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  61.38 
 
 		 291 aa  338  5.9999999999999996e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  61.43 
 
 		 303 aa  338  8e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  60.2 
 
 		 294 aa  331  8e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  59.86 
 
 		 297 aa  326  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  57.34 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  59.39 
 
 		 305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  54.42 
 
 		 406 aa  298  8e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 318 aa  290  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  56.31 
 
 		 307 aa  288  6e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  53.92 
 
 		 293 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  55.25 
 
 		 341 aa  286  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  56.08 
 
 		 317 aa  285  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  52.88 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 290 aa  281  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.71 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  54.48 
 
 		 326 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  53.87 
 
 		 305 aa  277  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  52.05 
 
 		 298 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  50.17 
 
 		 303 aa  271  7e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  51.69 
 
 		 292 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  40.55 
 
 		 299 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 		 299 aa  225  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.96 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.96 
 
 		 299 aa  209  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  39.02 
 
 		 299 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.6 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.14 
 
 		 309 aa  202  6e-51  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.58 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.93 
 
 		 297 aa  199  5e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.08 
 
 		 308 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  34.35 
 
 		 298 aa  195  7e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  34.84 
 
 		 305 aa  195  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 309 aa  192  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 303 aa  190  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  33.78 
 
 		 303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  33.45 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.99 
 
 		 298 aa  189  4e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  44.08 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  34.12 
 
 		 303 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  30.87 
 
 		 321 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  34.11 
 
 		 298 aa  186  3e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  34.45 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  40.71 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  35.59 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  32.31 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  31.01 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  32.46 
 
 		 312 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.88 
 
 		 296 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  30.64 
 
 		 309 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  32.99 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  37.33 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  40 
 
 		 294 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.39 
 
 		 245 aa  171  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  31.27 
 
 		 266 aa  171  1e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.54 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.62 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.42 
 
 		 305 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  41.7 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  28.9 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  36.24 
 
 		 297 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.13 
 
 		 344 aa  165  9e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  34.6 
 
 		 316 aa  163  3e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  41.7 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  41.84 
 
 		 318 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.08 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  38.68 
 
 		 332 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  41.7 
 
 		 936 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  39.55 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  40.27 
 
 		 916 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  38.58 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.55 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.97 
 
 		 411 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.33 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  41.15 
 
 		 942 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  33.87 
 
 		 319 aa  157  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  42.92 
 
 		 328 aa  157  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  34.35 
 
 		 360 aa  156  3e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.45 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.36 
 
 		 907 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  36.71 
 
 		 242 aa  156  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  41.07 
 
 		 1017 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  34.33 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  39.82 
 
 		 916 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  38.05 
 
 		 904 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  36.14 
 
 		 943 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  39.11 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  40 
 
 		 1071 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.33 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  36.73 
 
 		 935 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>