More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0698 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  100 
 
 
296 aa  588  1e-167  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  98.65 
 
 
296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  46.96 
 
 
298 aa  279  5e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  47.14 
 
 
294 aa  270  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  46.13 
 
 
294 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  46.13 
 
 
294 aa  267  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  45.12 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
294 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  45.12 
 
 
294 aa  263  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 
303 aa  263  3e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  45.39 
 
 
303 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  44.78 
 
 
303 aa  262  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  45.73 
 
 
294 aa  263  4e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 
294 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  45.79 
 
 
303 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  42.35 
 
 
312 aa  259  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  44.26 
 
 
299 aa  256  3e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  41.22 
 
 
299 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
299 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  42.61 
 
 
299 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  42.61 
 
 
299 aa  249  6e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  40.54 
 
 
321 aa  230  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  42.18 
 
 
298 aa  229  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 
319 aa  224  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
305 aa  223  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  42.52 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.53 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  42.23 
 
 
298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
309 aa  219  5e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.11 
 
 
309 aa  215  5.9999999999999996e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.8 
 
 
309 aa  215  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  42.67 
 
 
308 aa  215  9e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.02 
 
 
297 aa  211  9e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.95 
 
 
326 aa  211  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  41.5 
 
 
309 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  37.97 
 
 
296 aa  207  1e-52  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  37.46 
 
 
326 aa  206  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  39.46 
 
 
304 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  36.64 
 
 
406 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  36.43 
 
 
341 aa  198  7e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
266 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.49 
 
 
300 aa  198  9e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.06 
 
 
291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  38.36 
 
 
309 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  36.9 
 
 
317 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  40.45 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 
301 aa  194  1e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  37.11 
 
 
290 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 
305 aa  193  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  40.54 
 
 
303 aa  191  9e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.42 
 
 
315 aa  191  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  34.36 
 
 
298 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  35.29 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  35.93 
 
 
293 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  36.18 
 
 
292 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  34.74 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  35.02 
 
 
294 aa  182  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  38.39 
 
 
318 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  34.83 
 
 
297 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  35.03 
 
 
305 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  37.33 
 
 
295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.57 
 
 
315 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  31.62 
 
 
318 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  33.67 
 
 
294 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  38.43 
 
 
307 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  32.56 
 
 
316 aa  168  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  29.39 
 
 
339 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  39.01 
 
 
243 aa  166  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  39.01 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.44 
 
 
308 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.43 
 
 
293 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  34.98 
 
 
244 aa  158  9e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  32.15 
 
 
340 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  35.27 
 
 
332 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  38.05 
 
 
243 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  34.53 
 
 
244 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  31.79 
 
 
390 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  31.72 
 
 
320 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  31.72 
 
 
320 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  34.53 
 
 
244 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  35.27 
 
 
295 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.32 
 
 
241 aa  155  8e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  34.53 
 
 
244 aa  155  9e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  31.06 
 
 
298 aa  155  9e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  35.51 
 
 
244 aa  155  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 
244 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.96 
 
 
308 aa  155  1e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  34.08 
 
 
244 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  34.08 
 
 
244 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  34.08 
 
 
244 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  34.08 
 
 
244 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  34.08 
 
 
244 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0518  ABC transporter related protein  34.38 
 
 
248 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  34.08 
 
 
244 aa  154  2e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.6 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.18 
 
 
298 aa  153  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  34.36 
 
 
248 aa  152  5e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>