More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0581 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  100 
 
 
290 aa  582  1.0000000000000001e-165  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  62.59 
 
 
293 aa  358  4e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  61.3 
 
 
292 aa  358  6e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  57.88 
 
 
341 aa  324  9e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  58.31 
 
 
307 aa  323  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  56.66 
 
 
326 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  55.44 
 
 
326 aa  316  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  56.8 
 
 
317 aa  316  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  55.7 
 
 
406 aa  316  4e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  54.58 
 
 
303 aa  313  1.9999999999999998e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  55.44 
 
 
298 aa  310  2.9999999999999997e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  55.56 
 
 
305 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  52.4 
 
 
292 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  53.82 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  53.74 
 
 
295 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  52.53 
 
 
303 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  51.9 
 
 
291 aa  276  4e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  51.19 
 
 
294 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  49.66 
 
 
293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  50.85 
 
 
297 aa  264  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  52.38 
 
 
305 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  39.93 
 
 
299 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
299 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  38.23 
 
 
299 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  38.23 
 
 
299 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  38.93 
 
 
309 aa  211  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  37.41 
 
 
305 aa  211  2e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  36.67 
 
 
298 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
294 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 
319 aa  202  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 
301 aa  201  9.999999999999999e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  35.42 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.95 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.68 
 
 
309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 
294 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
309 aa  196  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36.43 
 
 
303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  36.77 
 
 
294 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 
296 aa  195  7e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.37 
 
 
309 aa  195  7e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  35.74 
 
 
309 aa  194  1e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
294 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  37.88 
 
 
303 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  41.15 
 
 
294 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  37.11 
 
 
296 aa  193  2e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  35.84 
 
 
294 aa  193  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.44 
 
 
309 aa  192  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 
294 aa  191  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 
303 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  36.08 
 
 
294 aa  191  1e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  36.93 
 
 
298 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  36.81 
 
 
298 aa  188  8e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  36.24 
 
 
298 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  32.66 
 
 
321 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  33.22 
 
 
312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  43.13 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  40.76 
 
 
304 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.15 
 
 
300 aa  178  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 
308 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  38.64 
 
 
315 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  36.57 
 
 
266 aa  172  5e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  36.36 
 
 
296 aa  172  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 
245 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.68 
 
 
315 aa  171  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  31.16 
 
 
298 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  37.25 
 
 
318 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  36.05 
 
 
318 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  37.92 
 
 
310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  39.91 
 
 
317 aa  166  4e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.09 
 
 
329 aa  166  5.9999999999999996e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  38.39 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  36.87 
 
 
297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  38.49 
 
 
321 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  33.33 
 
 
293 aa  160  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  34.9 
 
 
316 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  36.54 
 
 
308 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  33.56 
 
 
293 aa  159  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.01 
 
 
305 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  39.36 
 
 
329 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.55 
 
 
279 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  39.35 
 
 
932 aa  157  3e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.62 
 
 
321 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  38.11 
 
 
296 aa  156  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
340 aa  154  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  34.35 
 
 
237 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.09 
 
 
308 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  34.72 
 
 
319 aa  154  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  34.71 
 
 
298 aa  155  1e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.14 
 
 
312 aa  155  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  40.45 
 
 
316 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  39.55 
 
 
286 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  34.2 
 
 
236 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  40.72 
 
 
306 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  36.65 
 
 
246 aa  152  5e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.99 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  31.67 
 
 
303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.84 
 
 
328 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 
249 aa  151  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  37.35 
 
 
332 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>