More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1731 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  100 
 
 		 298 aa  603  1.0000000000000001e-171  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  47.47 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.96 
 
 		 309 aa  268  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  44.67 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  41.61 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  40.14 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  40.14 
 
 		 299 aa  236  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.26 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  38.38 
 
 		 294 aa  224  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  39.53 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  37.92 
 
 		 299 aa  219  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 		 296 aa  218  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  37.09 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  39.66 
 
 		 298 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  37.11 
 
 		 292 aa  209  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  32.3 
 
 		 303 aa  199  5e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  33.56 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  36.12 
 
 		 321 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.52 
 
 		 291 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.93 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  33.79 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 294 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  34.59 
 
 		 293 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  32.99 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  35.71 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.44 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  39.83 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 303 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.39 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  41.36 
 
 		 309 aa  183  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  36.76 
 
 		 406 aa  182  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  35.71 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.05 
 
 		 294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36.05 
 
 		 303 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.81 
 
 		 312 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  37.61 
 
 		 305 aa  181  9.000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  33.1 
 
 		 298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  35.37 
 
 		 294 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  33.11 
 
 		 317 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  32.76 
 
 		 297 aa  179  7e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  32.44 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  40.45 
 
 		 309 aa  177  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  31.74 
 
 		 294 aa  176  4e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  38.29 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  31.88 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  30.67 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 		 305 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.12 
 
 		 298 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  31.16 
 
 		 292 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  31.16 
 
 		 290 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  34.96 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.57 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  33.45 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.77 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  34.07 
 
 		 293 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  35.65 
 
 		 318 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  39.44 
 
 		 266 aa  155  1e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  32.23 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  36.49 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  36.12 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  30.46 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  31.76 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  31.33 
 
 		 241 aa  146  5e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  34.38 
 
 		 244 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  32.42 
 
 		 329 aa  145  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.38 
 
 		 303 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  33.33 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  31.37 
 
 		 329 aa  142  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  31.98 
 
 		 305 aa  142  6e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  31.44 
 
 		 293 aa  142  8e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  34.1 
 
 		 279 aa  142  9e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  30.62 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  33.03 
 
 		 297 aa  141  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  33.79 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  31.33 
 
 		 241 aa  141  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  30.85 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  30.71 
 
 		 311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0953  ABC transporter ATP-binding protein  32.44 
 
 		 241 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0992  ABC transporter related  32.44 
 
 		 241 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  32.49 
 
 		 268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  29.32 
 
 		 308 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  32.91 
 
 		 265 aa  139  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  31.36 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 297 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  30.6 
 
 		 237 aa  139  7.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 297 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  31.93 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  29.9 
 
 		 310 aa  138  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  31.93 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>