More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0946 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
319 aa  656    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  57.19 
 
 
305 aa  335  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  54.67 
 
 
304 aa  321  9.999999999999999e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  51.66 
 
 
309 aa  313  1.9999999999999998e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  52.12 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  50.97 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  48.34 
 
 
321 aa  298  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.23 
 
 
301 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
309 aa  248  7e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  41.89 
 
 
305 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  39.53 
 
 
299 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  41.86 
 
 
299 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 
308 aa  238  1e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  39.06 
 
 
299 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  39.06 
 
 
299 aa  230  3e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  38.54 
 
 
298 aa  226  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  41.28 
 
 
296 aa  224  1e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 
296 aa  223  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  39.2 
 
 
298 aa  222  6e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  36.79 
 
 
294 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  38.01 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  38.67 
 
 
298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  36.79 
 
 
298 aa  219  5e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.09 
 
 
298 aa  216  4e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  39.8 
 
 
300 aa  216  5e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.79 
 
 
309 aa  209  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.38 
 
 
326 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.67 
 
 
309 aa  209  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  39.53 
 
 
315 aa  202  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
290 aa  202  7e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  36.67 
 
 
292 aa  202  9e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.03 
 
 
297 aa  200  1.9999999999999998e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
305 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  43.78 
 
 
406 aa  199  5e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  42.55 
 
 
318 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  38.74 
 
 
293 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.65 
 
 
312 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  41.52 
 
 
341 aa  194  1e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  36.42 
 
 
326 aa  192  7e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.77 
 
 
291 aa  192  9e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  45.83 
 
 
329 aa  191  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
307 aa  190  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  35.55 
 
 
296 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  40.71 
 
 
295 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.67 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  41.28 
 
 
294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  41.3 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  35.25 
 
 
294 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  40.37 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  35.25 
 
 
303 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  34.92 
 
 
294 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
294 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  35.02 
 
 
303 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  40.37 
 
 
294 aa  181  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 
294 aa  180  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 
303 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  34.92 
 
 
294 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  41.2 
 
 
303 aa  180  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  40.37 
 
 
318 aa  178  1e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  39.45 
 
 
303 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  35.33 
 
 
315 aa  176  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  39.81 
 
 
298 aa  176  7e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  34.33 
 
 
316 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
266 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  37.1 
 
 
293 aa  169  6e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  35.33 
 
 
294 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  38.46 
 
 
305 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  37.27 
 
 
341 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  38.25 
 
 
294 aa  165  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  36.21 
 
 
297 aa  165  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.94 
 
 
279 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
308 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.57 
 
 
236 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  35.14 
 
 
296 aa  157  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 
316 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  36.2 
 
 
245 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  35.59 
 
 
338 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  32.89 
 
 
310 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  34.44 
 
 
293 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  33.19 
 
 
306 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  37.85 
 
 
250 aa  154  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  33.47 
 
 
308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  29.9 
 
 
306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
301 aa  152  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  29.08 
 
 
312 aa  152  7e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  30.49 
 
 
302 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
252 aa  152  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  29.64 
 
 
318 aa  152  1e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  30.26 
 
 
301 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.32 
 
 
316 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  36.21 
 
 
303 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
369 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  37.44 
 
 
235 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 
241 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.44 
 
 
305 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  35.14 
 
 
241 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
241 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  35.14 
 
 
241 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
261 aa  149  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>