More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2867 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  100 
 
 
318 aa  646    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  55.63 
 
 
329 aa  319  3e-86  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  44.16 
 
 
315 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.38 
 
 
309 aa  199  6e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  42.2 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 
308 aa  197  3e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  34.56 
 
 
298 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  34.23 
 
 
298 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  34.92 
 
 
299 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  36.83 
 
 
309 aa  193  4e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  45.05 
 
 
305 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 
305 aa  187  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  42.65 
 
 
304 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.64 
 
 
316 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  43.52 
 
 
309 aa  186  4e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 
294 aa  186  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.33 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  33.33 
 
 
299 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  33.33 
 
 
299 aa  183  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  31.53 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  39.62 
 
 
299 aa  181  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  40.37 
 
 
319 aa  178  1e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  35.83 
 
 
305 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  41.01 
 
 
406 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.83 
 
 
338 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
299 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  44.65 
 
 
309 aa  176  5e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
266 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
301 aa  173  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  39.3 
 
 
341 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  31.62 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  36.49 
 
 
308 aa  171  1e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
298 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  40.54 
 
 
326 aa  171  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  31.62 
 
 
296 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.73 
 
 
337 aa  169  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.47 
 
 
326 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  41.74 
 
 
293 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.65 
 
 
291 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  38.43 
 
 
292 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.44 
 
 
312 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.99 
 
 
309 aa  168  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.06 
 
 
345 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.36 
 
 
309 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  40.09 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 
305 aa  165  8e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.73 
 
 
316 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  35.43 
 
 
339 aa  165  9e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.67 
 
 
305 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
331 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40.09 
 
 
243 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  34.42 
 
 
297 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  41.84 
 
 
295 aa  163  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
307 aa  163  3e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  38.35 
 
 
339 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  31.06 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.98 
 
 
321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  36.04 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  38.71 
 
 
303 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 
339 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  39.09 
 
 
243 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  37.39 
 
 
340 aa  162  8.000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  30.82 
 
 
308 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  41.2 
 
 
318 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.95 
 
 
295 aa  161  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 
303 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  29.73 
 
 
303 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  30.03 
 
 
294 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.95 
 
 
293 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  31.99 
 
 
298 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 
318 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.18 
 
 
297 aa  160  3e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.32 
 
 
353 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  36.1 
 
 
293 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.5 
 
 
256 aa  159  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  30.03 
 
 
294 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  32.44 
 
 
302 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  39.21 
 
 
259 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  32.78 
 
 
325 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.37 
 
 
315 aa  159  8e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 
314 aa  158  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  36.09 
 
 
338 aa  158  9e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 
308 aa  158  9e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.35 
 
 
292 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  35.87 
 
 
244 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  29.73 
 
 
294 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 
320 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  36.77 
 
 
261 aa  158  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  38.08 
 
 
316 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  37.95 
 
 
279 aa  158  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
241 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
241 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  38.22 
 
 
272 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  38.01 
 
 
241 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.77 
 
 
345 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.57 
 
 
290 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
308 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>