More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0851 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  100 
 
 
298 aa  606  9.999999999999999e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  89.26 
 
 
298 aa  551  1e-156  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  88.26 
 
 
298 aa  548  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  45.39 
 
 
300 aa  283  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 
308 aa  255  6e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
309 aa  251  8.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  37.21 
 
 
305 aa  248  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  40.67 
 
 
309 aa  246  4e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  39.93 
 
 
294 aa  238  8e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  39.33 
 
 
305 aa  233  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  38.18 
 
 
321 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  40.2 
 
 
304 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  37.33 
 
 
299 aa  230  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  42.18 
 
 
296 aa  229  5e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
296 aa  228  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  38.54 
 
 
319 aa  226  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  38.31 
 
 
298 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 
299 aa  223  3e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  38.54 
 
 
309 aa  223  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  38.54 
 
 
315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  36.58 
 
 
316 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  36.04 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  38.23 
 
 
299 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  38.23 
 
 
299 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  37.15 
 
 
299 aa  219  5e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  38.57 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  37.19 
 
 
294 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
294 aa  212  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
303 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
294 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
303 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.64 
 
 
294 aa  210  3e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 
301 aa  209  4e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.9 
 
 
315 aa  209  5e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  37.2 
 
 
294 aa  207  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  36.64 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 
294 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  36.3 
 
 
303 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  36.3 
 
 
294 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
303 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.83 
 
 
297 aa  196  4.0000000000000005e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  36.01 
 
 
298 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.1 
 
 
309 aa  191  9e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
318 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.76 
 
 
326 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  34.03 
 
 
292 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  36.81 
 
 
290 aa  188  8e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  33.22 
 
 
305 aa  187  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  32.18 
 
 
406 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  34.75 
 
 
312 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  34.45 
 
 
295 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.44 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  35.29 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.19 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  31.53 
 
 
318 aa  182  4.0000000000000006e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
266 aa  181  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.27 
 
 
291 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  32.99 
 
 
307 aa  179  4.999999999999999e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  33.57 
 
 
293 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  33.1 
 
 
305 aa  177  1e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.22 
 
 
309 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  38.57 
 
 
329 aa  176  4e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  33.33 
 
 
326 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  37.04 
 
 
341 aa  175  7e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  32.77 
 
 
305 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  32.87 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  33.22 
 
 
293 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  32.53 
 
 
297 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1236  ABC transporter related  33.33 
 
 
310 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.143778  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  38.29 
 
 
339 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  36.24 
 
 
303 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  32.66 
 
 
317 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  31.45 
 
 
292 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  33.11 
 
 
306 aa  168  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 
318 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  39.74 
 
 
299 aa  167  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  31.72 
 
 
337 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 
318 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  30.56 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  41.59 
 
 
318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.41 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  31.49 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1746  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 
313 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.570352  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  32.46 
 
 
346 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  32.77 
 
 
293 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  31.54 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.94 
 
 
309 aa  162  6e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  33.77 
 
 
298 aa  162  6e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2699  ABC transporter related  31.35 
 
 
310 aa  162  7e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  37.67 
 
 
236 aa  162  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  32.11 
 
 
326 aa  162  9e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  32 
 
 
316 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
302 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  37.39 
 
 
309 aa  161  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 
245 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.48 
 
 
312 aa  160  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  36.91 
 
 
314 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  29 
 
 
315 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  36.04 
 
 
316 aa  160  2e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
305 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>