More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0227 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  100 
 
 
296 aa  597  1e-169  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.24 
 
 
309 aa  244  9.999999999999999e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.61 
 
 
298 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.12 
 
 
297 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  39.25 
 
 
299 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.53 
 
 
309 aa  231  1e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  39.25 
 
 
299 aa  231  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 
294 aa  229  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
299 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  36.73 
 
 
299 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  38.64 
 
 
296 aa  212  7.999999999999999e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  37.97 
 
 
298 aa  209  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  37.97 
 
 
296 aa  207  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 
299 aa  207  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  37.88 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  37.88 
 
 
294 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 
303 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 
294 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 
303 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  37.54 
 
 
303 aa  203  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
294 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
294 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
294 aa  202  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 
294 aa  202  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  37.88 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
305 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  35.55 
 
 
321 aa  196  5.000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.29 
 
 
326 aa  193  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  35.55 
 
 
304 aa  193  3e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  33.89 
 
 
309 aa  191  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  32.44 
 
 
303 aa  189  5e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
305 aa  188  7e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 
305 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
319 aa  186  5e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  34.87 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
309 aa  183  2.0000000000000003e-45  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.89 
 
 
301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  37.96 
 
 
303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  31.65 
 
 
326 aa  182  6e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.09 
 
 
315 aa  182  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  34.35 
 
 
293 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  32.99 
 
 
300 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  31.99 
 
 
292 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.54 
 
 
308 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  36.12 
 
 
406 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.29 
 
 
291 aa  177  3e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  31.88 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  32.88 
 
 
295 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  32.25 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
307 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  30.61 
 
 
317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
290 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  33.1 
 
 
298 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  40.16 
 
 
266 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  30.72 
 
 
318 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  32.53 
 
 
292 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  36.11 
 
 
341 aa  171  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  33.55 
 
 
312 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  33.48 
 
 
294 aa  168  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  34.55 
 
 
293 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  31.19 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.76 
 
 
298 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  30.82 
 
 
305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  32.41 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  30.58 
 
 
315 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  33.19 
 
 
237 aa  152  5e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  34.03 
 
 
236 aa  151  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.56 
 
 
293 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  37.67 
 
 
243 aa  149  6e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  30.17 
 
 
316 aa  149  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  32.46 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  32.46 
 
 
244 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.67 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  33.93 
 
 
318 aa  146  3e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  37.21 
 
 
238 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  34.68 
 
 
237 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.81 
 
 
243 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.81 
 
 
243 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  37.04 
 
 
238 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 
295 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  33.33 
 
 
294 aa  143  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  32.74 
 
 
303 aa  143  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  30.67 
 
 
332 aa  142  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  27.91 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  33.93 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  33.18 
 
 
279 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  32.02 
 
 
244 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  30.42 
 
 
321 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  30.4 
 
 
297 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  26.23 
 
 
316 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  31.96 
 
 
244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2378  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.43 
 
 
312 aa  139  4.999999999999999e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.460301  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  31.06 
 
 
291 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  35.02 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.74 
 
 
301 aa  139  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  30.09 
 
 
339 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.58 
 
 
293 aa  139  6e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  33.33 
 
 
295 aa  139  6e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.08 
 
 
312 aa  139  6e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>