More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0703 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 296 aa  589  1e-167  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  98.65 
 
 		 296 aa  580  1.0000000000000001e-165  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  46.96 
 
 		 298 aa  280  2e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  47.1 
 
 		 294 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  45.79 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  45.39 
 
 		 294 aa  262  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 		 294 aa  262  4e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  46.78 
 
 		 294 aa  262  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  45.05 
 
 		 294 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 294 aa  261  8e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  42.35 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  44.71 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  44.71 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  44.71 
 
 		 303 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  45.05 
 
 		 294 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  45.45 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  45.45 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  42.96 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  42.96 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  41.22 
 
 		 299 aa  249  3e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  42.62 
 
 		 299 aa  249  4e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  40.2 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  41.84 
 
 		 298 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  42.52 
 
 		 298 aa  225  6e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 319 aa  223  3e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 309 aa  221  8e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 305 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  41.5 
 
 		 298 aa  218  7e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.19 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.04 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.11 
 
 		 309 aa  216  4e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  42.02 
 
 		 308 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 		 309 aa  212  4.9999999999999996e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  38.64 
 
 		 296 aa  212  7.999999999999999e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.02 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.95 
 
 		 326 aa  210  3e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  38.23 
 
 		 326 aa  208  9e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  40.13 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  40.39 
 
 		 309 aa  207  2e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  36.99 
 
 		 406 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 303 aa  202  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  36.43 
 
 		 341 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  36.75 
 
 		 309 aa  199  5e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.93 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 266 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  36.39 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.15 
 
 		 300 aa  196  5.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  36.9 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  37.46 
 
 		 290 aa  195  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  40.45 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 		 305 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  34.95 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  36.64 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  40.54 
 
 		 303 aa  191  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  36.64 
 
 		 292 aa  190  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.42 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  35.09 
 
 		 305 aa  186  3e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  35.74 
 
 		 292 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  39.07 
 
 		 294 aa  182  9.000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  34.46 
 
 		 318 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  34.83 
 
 		 297 aa  178  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  35.27 
 
 		 305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  32.99 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  31.62 
 
 		 318 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.8 
 
 		 315 aa  172  7.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  33.22 
 
 		 307 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  33.67 
 
 		 294 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  32.89 
 
 		 316 aa  168  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  39.01 
 
 		 243 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  29.39 
 
 		 339 aa  163  3e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  38.57 
 
 		 243 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  35.43 
 
 		 293 aa  160  3e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1172  ABC transporter related  38.05 
 
 		 243 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  34.98 
 
 		 244 aa  157  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 340 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  35.27 
 
 		 332 aa  157  3e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  34.53 
 
 		 244 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  31.23 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  31.23 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  32.45 
 
 		 308 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  31.46 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  35.27 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0518  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 248 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  36.32 
 
 		 241 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  34.53 
 
 		 244 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  35.51 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  34.08 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  34.08 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  34.08 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  34.08 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  34.53 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  34.08 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  34.08 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  34.08 
 
 		 244 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.58 
 
 		 308 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  31.6 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.18 
 
 		 298 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  31.06 
 
 		 329 aa  152  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  34.36 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>