More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1781 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  100 
 
 
297 aa  588  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  94.22 
 
 
294 aa  542  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  65.17 
 
 
291 aa  372  1e-102  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  64.38 
 
 
292 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  65.75 
 
 
303 aa  360  2e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  65.75 
 
 
305 aa  345  4e-94  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  59.86 
 
 
295 aa  326  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  60.9 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  57.43 
 
 
341 aa  308  6.999999999999999e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  55.1 
 
 
326 aa  304  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  55.82 
 
 
406 aa  301  1e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  53.77 
 
 
293 aa  291  7e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  56.42 
 
 
317 aa  288  1e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  55.29 
 
 
292 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  54.15 
 
 
318 aa  285  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  55.41 
 
 
305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  54.08 
 
 
293 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  53.06 
 
 
307 aa  280  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  51.53 
 
 
298 aa  278  6e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  50.85 
 
 
290 aa  264  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  49.49 
 
 
303 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  36.55 
 
 
299 aa  202  8e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.84 
 
 
309 aa  199  7e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  35.25 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 
299 aa  196  3e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.15 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.15 
 
 
299 aa  195  8.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  34.92 
 
 
298 aa  194  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.45 
 
 
309 aa  194  1e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  32.53 
 
 
294 aa  192  5e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
301 aa  192  8e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  38.59 
 
 
309 aa  189  4e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.22 
 
 
297 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
299 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.76 
 
 
298 aa  179  7e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 
308 aa  177  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  34.83 
 
 
296 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  34.83 
 
 
296 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  37.71 
 
 
315 aa  178  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  34.68 
 
 
300 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  31.65 
 
 
294 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  32.33 
 
 
294 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  29.83 
 
 
321 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  32.53 
 
 
298 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  32.67 
 
 
303 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  32.69 
 
 
312 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  32.32 
 
 
294 aa  170  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 
294 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  32.32 
 
 
305 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  33.88 
 
 
316 aa  169  7e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  31.49 
 
 
298 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 
310 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  31.53 
 
 
298 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  31.19 
 
 
296 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 
294 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  30.03 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  31.33 
 
 
294 aa  166  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  36.21 
 
 
319 aa  165  8e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  31.33 
 
 
303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  30 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  31.27 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  38.18 
 
 
294 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  32.76 
 
 
315 aa  160  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  29.33 
 
 
309 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  33.64 
 
 
297 aa  156  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0373  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 
241 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  33.17 
 
 
266 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.36 
 
 
312 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  34.55 
 
 
341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.49 
 
 
331 aa  152  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  32.17 
 
 
256 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  36.45 
 
 
318 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
243 aa  151  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 
304 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 
326 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4932  ABC transporter related  31.18 
 
 
302 aa  149  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  39.63 
 
 
373 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  36.86 
 
 
306 aa  149  8e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.71 
 
 
320 aa  148  9e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.31 
 
 
329 aa  148  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  28.46 
 
 
266 aa  148  9e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  29.8 
 
 
258 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  39.62 
 
 
304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  38.83 
 
 
306 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
306 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06055  hypothetical protein  33.04 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  30.8 
 
 
237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  34.84 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  33.55 
 
 
306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  35.79 
 
 
304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  31.7 
 
 
319 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  35.95 
 
 
344 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.2 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  36.71 
 
 
304 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  36.6 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>