More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0835 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  100 
 
 		 307 aa  598  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  63.39 
 
 		 292 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  63.18 
 
 		 293 aa  348  9e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  62.13 
 
 		 326 aa  345  4e-94  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  62.37 
 
 		 406 aa  344  1e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  62.33 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  63.64 
 
 		 317 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  61.95 
 
 		 341 aa  330  1e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  58.31 
 
 		 290 aa  330  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  59.12 
 
 		 298 aa  317  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  56.04 
 
 		 303 aa  312  4.999999999999999e-84  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  58.42 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  57 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  56.31 
 
 		 295 aa  295  6e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  54.45 
 
 		 294 aa  293  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  53.06 
 
 		 297 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  54.48 
 
 		 291 aa  285  8e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  51.7 
 
 		 292 aa  283  4.0000000000000003e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  51.51 
 
 		 303 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  51.68 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  49.66 
 
 		 293 aa  255  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  39.93 
 
 		 299 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  43.34 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  36.27 
 
 		 299 aa  229  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.11 
 
 		 321 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  35.15 
 
 		 294 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  36.27 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  36.27 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.15 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.56 
 
 		 309 aa  210  2e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 309 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 294 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.47 
 
 		 297 aa  202  5e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 		 303 aa  202  6e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  36.86 
 
 		 303 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  35.81 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  36.86 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.92 
 
 		 312 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  36.52 
 
 		 294 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  33.78 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 		 301 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 294 aa  199  5e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  36.24 
 
 		 308 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  36.52 
 
 		 294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  36.39 
 
 		 303 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  35.71 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  42.54 
 
 		 319 aa  193  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.15 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  37.46 
 
 		 315 aa  192  5e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.22 
 
 		 309 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  32.35 
 
 		 309 aa  188  8e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  33.22 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  34.32 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  33.9 
 
 		 298 aa  185  7e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  37.5 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  32.99 
 
 		 298 aa  182  8.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  37.44 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.08 
 
 		 298 aa  176  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  38.07 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  38.7 
 
 		 294 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  38.43 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 266 aa  171  2e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  43.58 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  37.25 
 
 		 341 aa  165  8e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  37.83 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  35.79 
 
 		 306 aa  163  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  40.28 
 
 		 315 aa  163  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  34.19 
 
 		 319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  31.46 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.33 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  34.86 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  34.07 
 
 		 258 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 332 aa  159  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.5 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  36.24 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.45 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  33.66 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  41.27 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 		 306 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  33.22 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  38.59 
 
 		 329 aa  155  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 340 aa  155  7e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  29.37 
 
 		 303 aa  155  7e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  38.12 
 
 		 306 aa  155  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  41.55 
 
 		 316 aa  155  8e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  39.16 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  39.86 
 
 		 308 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  35.94 
 
 		 304 aa  154  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  33.55 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  33.76 
 
 		 318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  34.97 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>