More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1450 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  100 
 
 
299 aa  603  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  76.59 
 
 
299 aa  477  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  54.85 
 
 
299 aa  348  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  55.07 
 
 
299 aa  325  8.000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  55.07 
 
 
299 aa  325  8.000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  48.32 
 
 
298 aa  287  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
309 aa  279  5e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  49.32 
 
 
294 aa  277  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 
294 aa  276  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  48.47 
 
 
294 aa  275  6e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 
303 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 
303 aa  275  9e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  48.81 
 
 
294 aa  275  9e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  48.47 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  48.81 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  48 
 
 
294 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  48.14 
 
 
303 aa  272  6e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  45.79 
 
 
294 aa  268  7e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  48.84 
 
 
303 aa  268  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  43.33 
 
 
321 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  43.2 
 
 
305 aa  253  3e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  42.23 
 
 
305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 
296 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  42.62 
 
 
296 aa  249  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 
309 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  40.33 
 
 
304 aa  246  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.88 
 
 
326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
319 aa  241  1e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  40.58 
 
 
309 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  40.69 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  40.86 
 
 
309 aa  239  2.9999999999999997e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  39.87 
 
 
312 aa  239  4e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.23 
 
 
297 aa  239  4e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.07 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  43.34 
 
 
307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  42.47 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  39.19 
 
 
300 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  42.52 
 
 
326 aa  230  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  42.21 
 
 
317 aa  224  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  40.97 
 
 
341 aa  223  4e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  41.69 
 
 
293 aa  221  8e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  38.06 
 
 
298 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  36.18 
 
 
296 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  39.33 
 
 
308 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.92 
 
 
298 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  37.15 
 
 
298 aa  219  5e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
290 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  38 
 
 
303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  37.59 
 
 
298 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.88 
 
 
301 aa  215  8e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  39.02 
 
 
295 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
305 aa  209  4e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  40.34 
 
 
292 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
318 aa  207  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  38.7 
 
 
292 aa  205  6e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  39.04 
 
 
293 aa  203  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.31 
 
 
291 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  38.28 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  39.51 
 
 
315 aa  200  3e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  42.65 
 
 
266 aa  195  7e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
303 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  36.3 
 
 
294 aa  190  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  37.41 
 
 
294 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  34.48 
 
 
316 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  36.64 
 
 
297 aa  185  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.58 
 
 
279 aa  179  4e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  42.15 
 
 
241 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  40.18 
 
 
318 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  41.74 
 
 
251 aa  175  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.5 
 
 
312 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  35.27 
 
 
305 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  34.41 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.23 
 
 
303 aa  172  9e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  35.02 
 
 
329 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  34 
 
 
315 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.5 
 
 
316 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.33 
 
 
309 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.3 
 
 
337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.98 
 
 
309 aa  166  4e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  40.72 
 
 
259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  40.09 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  31.39 
 
 
312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  34.7 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  37.92 
 
 
328 aa  162  7e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  34.22 
 
 
298 aa  162  7e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.12 
 
 
293 aa  162  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  34.09 
 
 
305 aa  161  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.88 
 
 
316 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.95 
 
 
328 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.64 
 
 
308 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  37.61 
 
 
293 aa  161  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34 
 
 
309 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  41.47 
 
 
250 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  40.93 
 
 
259 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
369 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
302 aa  160  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
304 aa  159  5e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
261 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  32.06 
 
 
314 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>