More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0533 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  100 
 
 		 317 aa  622  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  76.87 
 
 		 341 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  75.5 
 
 		 326 aa  427  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  68.67 
 
 		 326 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  64.16 
 
 		 406 aa  360  1e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  66.23 
 
 		 305 aa  353  2e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  63.39 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  63.64 
 
 		 307 aa  345  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  58.75 
 
 		 303 aa  337  9.999999999999999e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  56.8 
 
 		 290 aa  331  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  59.18 
 
 		 292 aa  328  8e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  58.5 
 
 		 293 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  56.61 
 
 		 294 aa  301  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  56.42 
 
 		 297 aa  300  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  56.08 
 
 		 295 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  54.78 
 
 		 318 aa  293  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.61 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  52.38 
 
 		 292 aa  278  6e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 303 aa  278  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  53.38 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  47.1 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  42.21 
 
 		 299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  38.75 
 
 		 299 aa  230  3e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  37.46 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  37.46 
 
 		 299 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.39 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  35.76 
 
 		 299 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.24 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  34.78 
 
 		 321 aa  212  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  37.33 
 
 		 305 aa  206  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 294 aa  207  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  35.22 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  37.17 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  36.9 
 
 		 296 aa  202  4e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  36.9 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 308 aa  200  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  35.39 
 
 		 312 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.69 
 
 		 297 aa  192  9e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  31.51 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  33.78 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  34.68 
 
 		 294 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 303 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 303 aa  190  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 		 294 aa  189  5e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  41.3 
 
 		 319 aa  189  5.999999999999999e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  34.14 
 
 		 294 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 		 294 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  34.14 
 
 		 294 aa  188  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.45 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  33.11 
 
 		 298 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  33.79 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  37.46 
 
 		 294 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  35.82 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  33.11 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.54 
 
 		 315 aa  182  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  36.61 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  30.69 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  32.66 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  32.78 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  30.61 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  37.91 
 
 		 304 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  33 
 
 		 298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  36.36 
 
 		 309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  35.65 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.32 
 
 		 245 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  37.83 
 
 		 329 aa  170  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  40.09 
 
 		 318 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  37.09 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  32.7 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  35.06 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  32.7 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  35.12 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.09 
 
 		 259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  34.88 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  43.24 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  40.08 
 
 		 311 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  32.33 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  36.04 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  40.64 
 
 		 360 aa  163  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  36.75 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 241 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.58 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  33.05 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  33.05 
 
 		 241 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1452  ABC transporter-like  34.56 
 
 		 297 aa  162  8.000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218663  hitchhiker  0.00673378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  33.05 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 		 241 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  32.64 
 
 		 244 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  42.2 
 
 		 332 aa  161  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  38.55 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  40.18 
 
 		 306 aa  161  1e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.2 
 
 		 321 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.98 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>