More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0195 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  100 
 
 
237 aa  484  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  69.36 
 
 
236 aa  354  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  66.24 
 
 
238 aa  340  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  64.56 
 
 
243 aa  333  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  64.56 
 
 
238 aa  332  4e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  58.47 
 
 
247 aa  309  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  54.51 
 
 
414 aa  276  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  49.38 
 
 
241 aa  259  3e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 
241 aa  258  5.0000000000000005e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 
242 aa  255  4e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  48.54 
 
 
239 aa  254  9e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  48.55 
 
 
241 aa  251  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  48.55 
 
 
241 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  48.55 
 
 
241 aa  251  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
241 aa  251  6e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
241 aa  251  7e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
244 aa  250  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  48.55 
 
 
241 aa  250  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
241 aa  249  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 
241 aa  249  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  47.72 
 
 
241 aa  249  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
252 aa  249  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  47.72 
 
 
241 aa  248  5e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  46.67 
 
 
250 aa  242  3.9999999999999997e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  43.93 
 
 
240 aa  238  5.999999999999999e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1742  ABC transporter-related protein  46.52 
 
 
238 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.6629  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  42.02 
 
 
259 aa  217  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.8 
 
 
243 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  40.34 
 
 
257 aa  211  1e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  44.54 
 
 
249 aa  208  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
244 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  44.35 
 
 
247 aa  202  5e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  40.76 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  40.76 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  37.34 
 
 
249 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
253 aa  188  5.999999999999999e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  36.82 
 
 
247 aa  187  9e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.43 
 
 
245 aa  186  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  39.33 
 
 
246 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  35.68 
 
 
249 aa  181  7e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  34.32 
 
 
272 aa  180  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 
255 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.6 
 
 
308 aa  179  4.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  37.71 
 
 
258 aa  178  4.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1501  ABC transporter, ATP-binding protein  36.32 
 
 
303 aa  176  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.505204  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  36.89 
 
 
253 aa  176  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 
255 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  39.62 
 
 
369 aa  176  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  39.01 
 
 
319 aa  175  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  35.98 
 
 
259 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  37.14 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  37.39 
 
 
314 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  33.48 
 
 
293 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.32 
 
 
250 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  37.67 
 
 
319 aa  173  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  36.32 
 
 
287 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.14 
 
 
328 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  32.62 
 
 
268 aa  172  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  34.55 
 
 
305 aa  171  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0346  ABC transporter related  37.97 
 
 
237 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.67 
 
 
328 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  34.68 
 
 
303 aa  170  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  34.89 
 
 
256 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
266 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1462  ABC transporter related protein  35.54 
 
 
245 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 
301 aa  167  1e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  35.43 
 
 
288 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  34.22 
 
 
406 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  37.1 
 
 
308 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.89 
 
 
326 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
321 aa  166  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  32.92 
 
 
246 aa  167  2e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  37.95 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  36.55 
 
 
252 aa  164  8e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  33.33 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1572  ABC transporter ATP-binding protein  36.77 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  35.91 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  32.63 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  34.19 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
305 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.49 
 
 
315 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  35.48 
 
 
314 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  31.8 
 
 
295 aa  162  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  33.03 
 
 
254 aa  162  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  35.95 
 
 
253 aa  162  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  33.94 
 
 
292 aa  162  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0393  ABC transporter related  35.11 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  32.29 
 
 
287 aa  162  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  36.91 
 
 
344 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  34.39 
 
 
316 aa  161  8.000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  37.61 
 
 
305 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  39.25 
 
 
305 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  38.65 
 
 
318 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0376  ABC transporter related  34.67 
 
 
244 aa  161  9e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  36.2 
 
 
312 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.61 
 
 
305 aa  160  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>