More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1945 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  100 
 
 
303 aa  609  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  63.79 
 
 
326 aa  372  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  61.2 
 
 
305 aa  331  8e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  59.73 
 
 
298 aa  325  6e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  57.1 
 
 
341 aa  321  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  58.75 
 
 
317 aa  320  1.9999999999999998e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  57.53 
 
 
326 aa  320  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  54.58 
 
 
290 aa  313  1.9999999999999998e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  54.92 
 
 
293 aa  312  4.999999999999999e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  56.04 
 
 
307 aa  308  6.999999999999999e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  54.76 
 
 
406 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  54.08 
 
 
292 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  51.68 
 
 
303 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  52.72 
 
 
291 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  49.83 
 
 
292 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  49.16 
 
 
293 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  50.17 
 
 
295 aa  271  7e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  52.03 
 
 
305 aa  268  8.999999999999999e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  49.49 
 
 
294 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  50.84 
 
 
318 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  49.49 
 
 
297 aa  263  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  37.92 
 
 
299 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 
299 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  38.18 
 
 
299 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  38.18 
 
 
299 aa  224  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.46 
 
 
309 aa  223  2e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  38 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
294 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  43.75 
 
 
294 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
303 aa  209  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
303 aa  209  5e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  43.3 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  43.3 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  43.3 
 
 
294 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
303 aa  206  5e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  41.96 
 
 
294 aa  205  9e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  37.17 
 
 
298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  41.96 
 
 
303 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  41.94 
 
 
321 aa  199  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
294 aa  192  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.11 
 
 
309 aa  192  5e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  40.54 
 
 
296 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 
296 aa  191  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.02 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
309 aa  187  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  41.28 
 
 
304 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 
301 aa  188  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
266 aa  188  1e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  34.46 
 
 
305 aa  186  4e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  40.35 
 
 
309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  39 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  34.88 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  35.31 
 
 
300 aa  182  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  37.96 
 
 
296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  33.9 
 
 
309 aa  181  9.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
309 aa  181  1e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
305 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 
319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  39.11 
 
 
294 aa  177  2e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.29 
 
 
298 aa  175  8e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  40.89 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  37.94 
 
 
310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  40.25 
 
 
310 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  36.04 
 
 
321 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  34.68 
 
 
237 aa  170  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  34.63 
 
 
317 aa  170  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  36.24 
 
 
298 aa  170  3e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  42.2 
 
 
315 aa  170  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  36.09 
 
 
314 aa  169  4e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  37.31 
 
 
918 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  37.74 
 
 
390 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  38.24 
 
 
927 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  38.71 
 
 
318 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  37.98 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  41.13 
 
 
316 aa  163  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
308 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  34.4 
 
 
298 aa  162  7e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  40.72 
 
 
256 aa  162  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.55 
 
 
360 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  36.12 
 
 
916 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  41.07 
 
 
912 aa  161  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0280  ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 
244 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  41.78 
 
 
1017 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  38.17 
 
 
912 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  34.86 
 
 
298 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.32 
 
 
303 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  35.14 
 
 
320 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  34.8 
 
 
311 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  35.14 
 
 
320 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  40.62 
 
 
912 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.3 
 
 
315 aa  160  3e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  37.9 
 
 
315 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  34.53 
 
 
238 aa  159  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  41.52 
 
 
912 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.76 
 
 
308 aa  159  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.92 
 
 
312 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  34.53 
 
 
238 aa  159  7e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  39.82 
 
 
309 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>