More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08261 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
309 aa  637    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  63.96 
 
 
309 aa  424  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  62.83 
 
 
309 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  54.98 
 
 
305 aa  350  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  56.39 
 
 
304 aa  341  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  50 
 
 
321 aa  322  6e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  51.66 
 
 
319 aa  313  1.9999999999999998e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  43.97 
 
 
301 aa  258  7e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  43.19 
 
 
299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 
305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  43.52 
 
 
299 aa  247  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  40.67 
 
 
298 aa  246  4e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  50.67 
 
 
309 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  39.87 
 
 
298 aa  242  7e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  40 
 
 
298 aa  238  6.999999999999999e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  41.47 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  41.47 
 
 
299 aa  234  2.0000000000000002e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  39.6 
 
 
308 aa  230  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  39.93 
 
 
299 aa  225  9e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  40.52 
 
 
296 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  39.87 
 
 
296 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  37.33 
 
 
294 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 
303 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  37.33 
 
 
303 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
294 aa  209  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  37.87 
 
 
294 aa  209  6e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
294 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 
303 aa  207  1e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  37 
 
 
294 aa  207  2e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  36.84 
 
 
300 aa  207  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.69 
 
 
309 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  36.33 
 
 
303 aa  206  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.1 
 
 
297 aa  206  4e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  36.89 
 
 
315 aa  206  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  36.67 
 
 
294 aa  206  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  36.67 
 
 
294 aa  205  7e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  35.62 
 
 
298 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.2 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  43.38 
 
 
318 aa  199  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  32.34 
 
 
406 aa  198  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  35 
 
 
294 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
290 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  33 
 
 
341 aa  192  5e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.09 
 
 
309 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  44.04 
 
 
266 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  30.94 
 
 
318 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  32.35 
 
 
307 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  34.75 
 
 
293 aa  186  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  42.27 
 
 
298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  32.57 
 
 
296 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  30.13 
 
 
326 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  32.55 
 
 
291 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  33.55 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  40.09 
 
 
329 aa  182  8.000000000000001e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  34.2 
 
 
303 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  29.87 
 
 
303 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  36.6 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  34.12 
 
 
315 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  32.92 
 
 
312 aa  176  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.33 
 
 
279 aa  176  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  32.03 
 
 
292 aa  175  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  37.07 
 
 
295 aa  172  9e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  30.41 
 
 
298 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  37.5 
 
 
293 aa  170  3e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  30.69 
 
 
317 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  32.45 
 
 
296 aa  169  4e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  30.13 
 
 
292 aa  169  6e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  28.76 
 
 
305 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  28.9 
 
 
295 aa  167  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  30 
 
 
294 aa  167  2e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  30.03 
 
 
297 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  30.92 
 
 
311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  32.34 
 
 
316 aa  165  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  36 
 
 
259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  31.73 
 
 
316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.65 
 
 
243 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.39 
 
 
295 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  31.63 
 
 
319 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.22 
 
 
243 aa  161  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  26.97 
 
 
337 aa  160  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  37.07 
 
 
241 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  37.61 
 
 
261 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
302 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  31.39 
 
 
302 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  30.1 
 
 
312 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  28.81 
 
 
312 aa  158  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  34.32 
 
 
315 aa  158  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  31.7 
 
 
301 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  36.65 
 
 
270 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  39.9 
 
 
272 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  32.17 
 
 
326 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
341 aa  158  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.14 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.14 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  30.75 
 
 
314 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  29.55 
 
 
322 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  31.48 
 
 
301 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  36.53 
 
 
311 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.34 
 
 
251 aa  157  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>