More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0121 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  100 
 
 
270 aa  532  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  60.98 
 
 
279 aa  308  6.999999999999999e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  62.95 
 
 
261 aa  288  5.0000000000000004e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  62.2 
 
 
272 aa  285  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  59.17 
 
 
259 aa  281  6.000000000000001e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  57.49 
 
 
253 aa  278  7e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  54.8 
 
 
252 aa  268  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  59.58 
 
 
250 aa  263  2e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  59.24 
 
 
266 aa  259  5.0000000000000005e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  44.4 
 
 
257 aa  222  4.9999999999999996e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  44.26 
 
 
259 aa  218  7.999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  44.66 
 
 
250 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  45.05 
 
 
313 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  41.63 
 
 
245 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  44.59 
 
 
313 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  39.75 
 
 
247 aa  198  7e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  41.15 
 
 
250 aa  198  9e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  41.15 
 
 
250 aa  198  9e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 
313 aa  196  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
309 aa  196  3e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  43.14 
 
 
316 aa  195  7e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  41.39 
 
 
252 aa  194  2e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  48.65 
 
 
311 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  42.4 
 
 
356 aa  192  6e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  47.75 
 
 
314 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
327 aa  190  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
309 aa  190  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.67 
 
 
316 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  44.39 
 
 
309 aa  188  5.999999999999999e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  44 
 
 
316 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  41.95 
 
 
326 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  42.49 
 
 
246 aa  186  2e-46  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  42.15 
 
 
337 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  37.24 
 
 
246 aa  186  4e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  45.11 
 
 
253 aa  186  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 
309 aa  186  5e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  40.99 
 
 
308 aa  185  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  44.34 
 
 
338 aa  185  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  45.25 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.15 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  40.98 
 
 
243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  43.11 
 
 
310 aa  183  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  40.87 
 
 
241 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  44.73 
 
 
238 aa  183  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  37.24 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0040  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.14 
 
 
321 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  40.43 
 
 
241 aa  182  6e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  41.15 
 
 
247 aa  182  7e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  40 
 
 
316 aa  181  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  37.8 
 
 
250 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.26 
 
 
333 aa  181  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  38.17 
 
 
249 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  45.5 
 
 
314 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  37.78 
 
 
304 aa  180  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  41.08 
 
 
241 aa  180  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38.87 
 
 
252 aa  180  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  42.27 
 
 
298 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  40.83 
 
 
247 aa  179  4e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.75 
 
 
316 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  39.75 
 
 
243 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  48.47 
 
 
318 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 
259 aa  178  9e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
318 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 
279 aa  178  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  39.38 
 
 
310 aa  178  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  47.96 
 
 
318 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  37.34 
 
 
241 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
241 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  37.6 
 
 
241 aa  177  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
241 aa  177  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  37.34 
 
 
241 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  41.67 
 
 
328 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  41.89 
 
 
302 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.16 
 
 
253 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
251 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  39.57 
 
 
239 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  42.53 
 
 
334 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.18 
 
 
906 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  37.34 
 
 
241 aa  176  3e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  36.86 
 
 
306 aa  176  3e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  41.18 
 
 
906 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  41.96 
 
 
314 aa  176  4e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
242 aa  176  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  39.69 
 
 
287 aa  176  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  40 
 
 
306 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  36.51 
 
 
241 aa  175  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  40.28 
 
 
328 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  38.99 
 
 
369 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  43.56 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  47.45 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  42.74 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.67 
 
 
360 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1678  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35.98 
 
 
243 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00600162  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  38.52 
 
 
512 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  41.32 
 
 
906 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  36.9 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  36.78 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  36.51 
 
 
241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>