More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2403 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2403  ABC transporter related protein  100 
 
 		 309 aa  626  1e-178  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.983822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  47.08 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 299 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  46.46 
 
 		 299 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  42.33 
 
 		 321 aa  261  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1177  ABC transporter related  43.1 
 
 		 298 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0179844  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  44.3 
 
 		 304 aa  258  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  42.86 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  42.86 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  51.12 
 
 		 309 aa  253  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 301 aa  253  3e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  40.2 
 
 		 298 aa  251  9.000000000000001e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  42.11 
 
 		 305 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_002950  PG0946  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 319 aa  248  6e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.15139 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  44.97 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  39.19 
 
 		 298 aa  247  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  40.79 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  38.67 
 
 		 298 aa  244  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  50.67 
 
 		 309 aa  242  5e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  40.67 
 
 		 299 aa  242  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5258  ABC transporter, ATP-binding protein  40.68 
 
 		 294 aa  236  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 308 aa  231  1e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  40.2 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  40.27 
 
 		 294 aa  229  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  39.86 
 
 		 303 aa  229  6e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 294 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 		 294 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  39.86 
 
 		 303 aa  228  1e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  39.53 
 
 		 303 aa  225  8e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  39.53 
 
 		 294 aa  225  9e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  39.86 
 
 		 303 aa  224  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  40.54 
 
 		 296 aa  221  8e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  41.94 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  40.2 
 
 		 296 aa  219  5e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.57 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  41.28 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0732  ABC transporter related protein  41.06 
 
 		 318 aa  214  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.515959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  36.79 
 
 		 297 aa  213  3.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  38.93 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1057  ABC transporter related  36.25 
 
 		 312 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  39.26 
 
 		 293 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.19 
 
 		 326 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  38.13 
 
 		 406 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1946  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  35.47 
 
 		 309 aa  205  7e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.036978  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2742  ABC transporter related  39.06 
 
 		 292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.145736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  39.73 
 
 		 291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381076  normal  0.317185 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1731  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  37.09 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000125196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  38.89 
 
 		 307 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  37.92 
 
 		 341 aa  198  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1451  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 266 aa  198  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0850349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  37.3 
 
 		 326 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0533  ABC transporter related  37.17 
 
 		 317 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000671777  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 298 aa  194  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  40.46 
 
 		 293 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  37.79 
 
 		 295 aa  192  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  33.89 
 
 		 296 aa  191  9e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  41.38 
 
 		 303 aa  191  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1808  ABC transporter related  37.76 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000539962 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1795  ABC transporter related  37.84 
 
 		 294 aa  191  2e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.881236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1781  ABC transporter related  38.59 
 
 		 297 aa  189  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286846 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  35.71 
 
 		 303 aa  187  1e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  37.05 
 
 		 305 aa  187  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  43.13 
 
 		 315 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  35.84 
 
 		 316 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3029  ABC transporter related  35.42 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000334829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  44.65 
 
 		 318 aa  176  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.13 
 
 		 312 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 311 aa  173  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.63 
 
 		 279 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  36.4 
 
 		 251 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  38.84 
 
 		 241 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  39.08 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  38.84 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2329  ABC transporter-like protein  42.67 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.613206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  39.08 
 
 		 248 aa  169  8e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  32.47 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  36.32 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  37.2 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  38.97 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1501  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.45 
 
 		 248 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.37 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  30.95 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  37.18 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  38.03 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  36.32 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  39.81 
 
 		 329 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  39.91 
 
 		 338 aa  163  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  37.5 
 
 		 250 aa  163  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  36.75 
 
 		 244 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  36.75 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  36.75 
 
 		 244 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 252 aa  162  7e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.37 
 
 		 243 aa  162  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 301 aa  162  9e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  37.18 
 
 		 244 aa  162  9e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  33.02 
 
 		 341 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  37.67 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>