More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1273 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1273  ABC transporter related  100 
 
 
318 aa  627  1e-179  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  37.78 
 
 
252 aa  171  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  32.47 
 
 
329 aa  169  8e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  34.11 
 
 
304 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.76 
 
 
331 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  33.76 
 
 
331 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  37.25 
 
 
290 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  30.74 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  33.55 
 
 
303 aa  166  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3683  bacitracin transport ATP-binding protein  33.89 
 
 
303 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  36.28 
 
 
245 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.22 
 
 
303 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  35.14 
 
 
457 aa  166  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  36.21 
 
 
305 aa  166  6.9999999999999995e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.44 
 
 
305 aa  165  8e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0851  sodium extrusion protein NatA, putative  30.56 
 
 
298 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0484534  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  32.17 
 
 
308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 
331 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.07 
 
 
319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  36.27 
 
 
304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  38.11 
 
 
302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.89 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  32.56 
 
 
305 aa  163  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  34.34 
 
 
308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  33.55 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  29.39 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 
305 aa  162  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  33.44 
 
 
305 aa  162  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  33.11 
 
 
305 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  33.88 
 
 
312 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  32.6 
 
 
338 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  33.11 
 
 
305 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  31.8 
 
 
316 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.4 
 
 
253 aa  162  1e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  33.11 
 
 
305 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  33.11 
 
 
305 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_755  ABC transproter, ATP-binding protein  29.37 
 
 
298 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0604586  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0770  ABC transporter related  28.81 
 
 
298 aa  160  2e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  30.03 
 
 
319 aa  161  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  29.7 
 
 
309 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  33 
 
 
330 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2602  ABC transporter related  35.39 
 
 
341 aa  159  5e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.43511  normal  0.142388 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  32.8 
 
 
344 aa  159  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  31.09 
 
 
325 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  36.68 
 
 
240 aa  159  6e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  34.38 
 
 
317 aa  159  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  33.78 
 
 
305 aa  159  7e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.4 
 
 
242 aa  159  8e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
314 aa  159  8e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  31.25 
 
 
306 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
302 aa  158  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  31.63 
 
 
320 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
330 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  31.63 
 
 
320 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  41.2 
 
 
293 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  41.36 
 
 
406 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  33.33 
 
 
334 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
300 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  32.69 
 
 
305 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
311 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  36.96 
 
 
308 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  31.17 
 
 
317 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  32.95 
 
 
308 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.99 
 
 
249 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  33.56 
 
 
301 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  32.03 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  36.92 
 
 
244 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  35.35 
 
 
292 aa  155  6e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  29.55 
 
 
315 aa  156  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  30.35 
 
 
331 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0858  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
303 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00621522  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 
305 aa  155  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  30.59 
 
 
336 aa  155  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2135  ABC transporter related protein  31.56 
 
 
355 aa  155  8e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  29.35 
 
 
328 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  31.25 
 
 
310 aa  154  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
304 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  37 
 
 
309 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4174  ABC transporter related  39.11 
 
 
295 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  31.53 
 
 
319 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  36.28 
 
 
305 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  29.77 
 
 
369 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
309 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  31.92 
 
 
304 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  30.35 
 
 
314 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  34.89 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  29.47 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  33.22 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  31.17 
 
 
256 aa  153  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  33.33 
 
 
301 aa  153  4e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  33.18 
 
 
244 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  34.07 
 
 
324 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1385  ABC transporter related  38.29 
 
 
293 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.208813  normal  0.990681 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  34.12 
 
 
326 aa  152  5e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  36.18 
 
 
305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  32.24 
 
 
747 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  32.12 
 
 
300 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  34.24 
 
 
301 aa  152  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>