More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1284 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  100 
 
 		 334 aa  679    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  83.69 
 
 		 338 aa  553  1e-156  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  56.88 
 
 		 326 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  62.3 
 
 		 316 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  43.71 
 
 		 314 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  45.25 
 
 		 311 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  44.59 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  33.54 
 
 		 325 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  34.21 
 
 		 344 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  45.78 
 
 		 314 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.16 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.24 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.73 
 
 		 343 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.93 
 
 		 338 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  40.54 
 
 		 256 aa  189  5e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.82 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  33.64 
 
 		 331 aa  188  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  44.1 
 
 		 303 aa  188  1e-46  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  37.46 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.09 
 
 		 330 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.55 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  34.31 
 
 		 320 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  32.46 
 
 		 308 aa  186  7e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  35.62 
 
 		 369 aa  186  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.92 
 
 		 345 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  40.26 
 
 		 319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  32.59 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  41.52 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 251 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  32.59 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  30.1 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  33.77 
 
 		 328 aa  183  3e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0452  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.98 
 
 		 309 aa  183  5.0000000000000004e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000639628  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  38.82 
 
 		 329 aa  182  6e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.1 
 
 		 305 aa  182  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1879  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.98 
 
 		 316 aa  182  8.000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  36.89 
 
 		 311 aa  182  9.000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  38.81 
 
 		 236 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8157  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.38 
 
 		 314 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.41 
 
 		 446 aa  181  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  32.37 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.45 
 
 		 334 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 		 327 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  33.44 
 
 		 328 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  33.74 
 
 		 334 aa  179  8e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4339  ABC-type transport system, ATPase component  36.25 
 
 		 305 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.037549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.25 
 
 		 308 aa  179  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.87 
 
 		 305 aa  178  9e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.59 
 
 		 312 aa  179  9e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  31.49 
 
 		 317 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.98 
 
 		 353 aa  178  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0869  ABC transporter related  42.41 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.348691 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1123  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.82 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.716234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.47 
 
 		 321 aa  177  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  43.24 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38.46 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.24 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.19 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.2 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  36.89 
 
 		 311 aa  177  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.41 
 
 		 327 aa  177  3e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.57 
 
 		 307 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.8 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  37.87 
 
 		 305 aa  176  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5082  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 314 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.682082 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.38 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.44 
 
 		 324 aa  176  5e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  32.69 
 
 		 315 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  35.78 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  42.47 
 
 		 279 aa  176  6e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.97 
 
 		 321 aa  176  6e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.11 
 
 		 305 aa  176  7e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  36.73 
 
 		 243 aa  176  7e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 		 342 aa  176  7e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  32.91 
 
 		 360 aa  175  9e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  33.33 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5258  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.84 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4511  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.58 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0903  ABC transporter related  43.13 
 
 		 303 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  34.77 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.11 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4939  ABC transporter related  36.93 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0242124 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7216  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.62 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.927821  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.86 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  39.37 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.96 
 
 		 321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3105  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.07 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.84 
 
 		 243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3165  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.07 
 
 		 310 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337194  normal  0.603146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  32.58 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  31.07 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0667  ABC transporter related  33.45 
 
 		 317 aa  173  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.747248  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4329  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.76 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.57 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  42.38 
 
 		 325 aa  172  5e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  40.25 
 
 		 298 aa  172  5.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>