More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4354 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  100 
 
 		 249 aa  490  1e-137  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  74.7 
 
 		 249 aa  369  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  68.57 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  46.55 
 
 		 259 aa  221  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  46.43 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  46.22 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  46.22 
 
 		 250 aa  210  2e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  40.42 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 250 aa  205  5e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  45.38 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  41.08 
 
 		 241 aa  204  2e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  40.25 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  44.98 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  42.37 
 
 		 246 aa  197  1.0000000000000001e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  41.2 
 
 		 252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  42.19 
 
 		 242 aa  197  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  43.23 
 
 		 249 aa  195  6e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  40.66 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  41.38 
 
 		 259 aa  192  5e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  37.34 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  39.33 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  40.66 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  40.66 
 
 		 241 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  42.56 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  37.89 
 
 		 250 aa  188  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.59 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  39 
 
 		 241 aa  188  7e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  41.45 
 
 		 241 aa  188  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  40.83 
 
 		 256 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 244 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  43.39 
 
 		 255 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  40.26 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  43.39 
 
 		 255 aa  185  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  44.3 
 
 		 247 aa  184  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  44.25 
 
 		 244 aa  184  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0114  ABC transporter related  41.41 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  41.91 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  41.15 
 
 		 244 aa  182  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  41.3 
 
 		 256 aa  181  7e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.22 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  44.16 
 
 		 247 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 276 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  41.59 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  41.59 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  41.42 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  41.59 
 
 		 244 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  38.27 
 
 		 247 aa  178  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  41.15 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1419  ABC transporter related  40.59 
 
 		 246 aa  178  9e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.441429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  41.05 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  41.05 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  40.17 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  40.42 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  41.48 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2482  ABC transporter-related protein  40.34 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.988214  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1130  ABC transporter related  39.44 
 
 		 258 aa  176  2e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.774133  hitchhiker  0.000478037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  41.95 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  41.05 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.92 
 
 		 295 aa  176  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  41.59 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  39.43 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  41.4 
 
 		 309 aa  175  5e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  40.39 
 
 		 328 aa  175  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.29 
 
 		 338 aa  176  5e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  44.78 
 
 		 294 aa  175  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  41.05 
 
 		 244 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.96 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  40.91 
 
 		 253 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.89 
 
 		 312 aa  174  9e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0407  ABC transporter related  37.61 
 
 		 240 aa  174  9e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  41.98 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  40.17 
 
 		 244 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4674  ABC transporter related  35.27 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 318 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  40 
 
 		 261 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  37.3 
 
 		 258 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  41.59 
 
 		 337 aa  172  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  38.17 
 
 		 245 aa  172  5e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  40.71 
 
 		 244 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.91 
 
 		 320 aa  171  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.44 
 
 		 293 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  38.87 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0276  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  43.1 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.16 
 
 		 321 aa  169  3e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.53 
 
 		 380 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0867076  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  40.64 
 
 		 309 aa  168  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4584  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 243 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.152931  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  40.65 
 
 		 279 aa  168  8e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1502  ABC transporter related  42.24 
 
 		 243 aa  168  9e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.64 
 
 		 305 aa  168  9e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.47 
 
 		 316 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  38.52 
 
 		 259 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>