More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23110 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 293 aa  577  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.54 
 
 		 256 aa  308  5e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  64.96 
 
 		 272 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  62.31 
 
 		 268 aa  305  7e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  64.4 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  64.14 
 
 		 254 aa  296  3e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  64 
 
 		 254 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.5 
 
 		 295 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  61.94 
 
 		 279 aa  291  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.98 
 
 		 274 aa  281  1e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  60.16 
 
 		 249 aa  278  6e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  59.76 
 
 		 252 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  55.02 
 
 		 306 aa  268  8.999999999999999e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  60.56 
 
 		 257 aa  262  4e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  48.6 
 
 		 301 aa  261  6.999999999999999e-69  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  55.95 
 
 		 254 aa  259  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  57.85 
 
 		 259 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  58.54 
 
 		 266 aa  255  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  58.59 
 
 		 297 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  50.4 
 
 		 261 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  44.36 
 
 		 259 aa  216  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  49.19 
 
 		 255 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  48.79 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  46.59 
 
 		 253 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.32 
 
 		 249 aa  172  7.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  42.44 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  36.71 
 
 		 239 aa  168  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 244 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  37.66 
 
 		 241 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  36.29 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  36.82 
 
 		 241 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  36.82 
 
 		 241 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  35.98 
 
 		 259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  35.17 
 
 		 241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0929  ABC transporter related  40.71 
 
 		 253 aa  163  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.750734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  42.79 
 
 		 305 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  38.2 
 
 		 302 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  34.32 
 
 		 241 aa  160  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.02 
 
 		 242 aa  160  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  32.91 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  36.44 
 
 		 346 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  36.84 
 
 		 346 aa  156  3e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2122  ABC transporter-related protein  35.15 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.620855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2248  ABC transporter related  40.67 
 
 		 315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  32.09 
 
 		 253 aa  155  8e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4311  ABC transporter related  40.25 
 
 		 317 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 252 aa  155  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2857  ABC transporter, ATP-binding protein  33.91 
 
 		 247 aa  155  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00741343  hitchhiker  0.00816683 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  33.2 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.33 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  33.2 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  38.18 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.65 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  35 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  31.93 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  32.89 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  36.24 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  35.09 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  39.73 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.37 
 
 		 334 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  36.53 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.44 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  39.56 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.09 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1793  ABC transporter related  38.33 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00000132087  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  36.7 
 
 		 337 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3071  ABC transporter related protein  34.75 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.710485  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  34.6 
 
 		 251 aa  150  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.44 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0718  ABC transporter related  37.85 
 
 		 314 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  36.36 
 
 		 593 aa  149  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  39.64 
 
 		 334 aa  149  5e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  36.86 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  30.74 
 
 		 245 aa  149  7e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  31.82 
 
 		 249 aa  149  7e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40.98 
 
 		 356 aa  149  8e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.04 
 
 		 241 aa  148  8e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  33.91 
 
 		 236 aa  149  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5304  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.45 
 
 		 311 aa  148  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.664589  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  41.36 
 
 		 337 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.27 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3667  ABC transporter related  38.81 
 
 		 311 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.19 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  38.18 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  32.22 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  33.62 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.58 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 330 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  34.41 
 
 		 414 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  37.67 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 		 312 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>