More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3107 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3107  ABC transporter related  100 
 
 		 297 aa  587  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000121464  hitchhiker  0.00525293 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2324  ABC transporter related  60.4 
 
 		 272 aa  290  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000107108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  63.31 
 
 		 259 aa  290  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08250  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.92 
 
 		 274 aa  290  3e-77  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.905308  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07170  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.15 
 
 		 256 aa  289  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.143642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2592  ABC transporter related  57.51 
 
 		 268 aa  287  1e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0099821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3072  ABC transporter related protein  61.04 
 
 		 254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0146986  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2692  ABC transporter related  59.76 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.733393  normal  0.0930337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2751  ABC transporter related  59.27 
 
 		 249 aa  281  7.000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36090  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.6 
 
 		 295 aa  281  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00151864  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1123  ABC transporter related protein  59.76 
 
 		 257 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768218  normal  0.140519 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5012  ABC transporter related  61.13 
 
 		 254 aa  281  1e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000281366 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0943  ABC transporter related protein  56.97 
 
 		 276 aa  278  9e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.59 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4500  ABC transporter related  59.92 
 
 		 254 aa  275  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0737614  normal  0.13568 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2864  ABC transporter related  56.4 
 
 		 261 aa  269  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141739  normal  0.0244228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2589  ATP-binding transport protein NatA  58.3 
 
 		 266 aa  266  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.408024  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0974  ABC transporter related protein  54.8 
 
 		 279 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.372476  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1843  multidrug ABC transporter ATPase  51.19 
 
 		 306 aa  255  6e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1137  ABC transporter, ATP-binding protein  49.79 
 
 		 301 aa  244  1.9999999999999999e-63  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2072  ABC transporter-related protein  47.04 
 
 		 255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.743004  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1768  ABC transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 255 aa  215  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2049  ABC transporter related  47.6 
 
 		 253 aa  215  9e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.106056  normal  0.368716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0543  ABC transporter related  38.31 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  39.33 
 
 		 259 aa  192  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15310  ABC transporter related  36.75 
 
 		 239 aa  189  7e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  40.83 
 
 		 244 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1689  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 252 aa  183  3e-45  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.62 
 
 		 253 aa  181  1e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.99 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3781  ABC transporter-related protein  41.1 
 
 		 244 aa  181  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0070  ATP-binding transport protein NatA  39.74 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.24 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0075  ABC transporter related  38.98 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0067  ABC transporter related  39.08 
 
 		 244 aa  178  9e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  35.77 
 
 		 274 aa  178  9e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.51 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.51 
 
 		 250 aa  178  9e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0070  ABC transporter related  38.98 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4279  ABC transporter related  38.98 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3008  ABC transporter related  37.39 
 
 		 236 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000346621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0056  ABC transporter related  37.87 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0075  ABC transporter related  40 
 
 		 244 aa  176  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000273343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  36.29 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0073  ABC transporter related  39.32 
 
 		 244 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.334195 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0071  ABC transporter related  39.32 
 
 		 244 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  37.34 
 
 		 247 aa  176  5e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4191  ABC transporter related  39.57 
 
 		 244 aa  176  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238897  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  38.14 
 
 		 328 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40 
 
 		 250 aa  175  7e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0072  ABC transporter related  38.98 
 
 		 244 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  39.92 
 
 		 249 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02799  sodium ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 		 248 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  39.91 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  40.47 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0302  ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0741168  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  33.75 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3127  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.497451  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3034  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00899121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4865  ABC transporter related  38.14 
 
 		 244 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.27 
 
 		 279 aa  172  9e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3357  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.373891  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3140  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0670261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3365  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0133936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3387  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3362  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7157  putative ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.902502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  39.13 
 
 		 240 aa  171  2e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1289  ABC transporter related  36.68 
 
 		 242 aa  171  2e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.077287  hitchhiker  0.00948798 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  171  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  38.29 
 
 		 295 aa  169  4e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3063  ABC transporter related  35.47 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00790593  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 266 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2038  ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 242 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000176245  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4461  ABC transporter-related protein  39.41 
 
 		 244 aa  169  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.623703 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0297  ABC transporter  32.91 
 
 		 241 aa  169  6e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3341  ABC transporter, ATP-binding protein  34.58 
 
 		 244 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1367  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  37.13 
 
 		 245 aa  169  8e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0150774  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.72 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.83 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 318 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1889  ABC transporter, ATP-binding protein  34.75 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0723  ATP-binding transport protein NatA  38.05 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  42.25 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  35.68 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3576  ATP-binding transport protein NatA  37.39 
 
 		 244 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  41.31 
 
 		 300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0070  heme exporter protein CcmA  39.05 
 
 		 337 aa  166  2.9999999999999998e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.431821  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0440  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 868 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.620247 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0195  ABC transporter related  32.05 
 
 		 237 aa  165  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3873  ABC transporter related  36.63 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1004  ABC transporter related  36.52 
 
 		 237 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00470286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2322  ABC transporter related  39.72 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  35.04 
 
 		 414 aa  163  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  39.34 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  35.78 
 
 		 241 aa  163  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1446  ABC transporter related  39.33 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>